Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.297660	Zfp426	zinc finger protein 426	9	9 37.0 cM	235028
Gene Ontology	intracellular | nucleic acid binding | regulation of transcription, DNA-dependent
Human Homolog	ZNF426[zinc finger protein 426]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 72 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GTCCTTCAGA (2) TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAGTTAA TTTCTGCCCA 24.3 0.0243 Cb medulloblastoma TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 106.3 0.1063 P8 GC+1d culture GACTTCCTGT (3) TATAAAAAAA (2) TATAAAATAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAGTTAA TTTCTGCCCA 27.4 0.0274 P8 GC+SHH+1d culture GTCCTTCAGA (2) TATAAAAAAA (2) TATAAAATAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 63.3 0.0633 3T3 fibroblasts TCAAAAAAAA (2) 7 0.007 E15 cortex GTCCTTCAGA (2) TCAAAAAAAA (2) 19.7 0.0197 P1 cortex TCAAAAAAAA (2) 22.7 0.0227 Hypothalamus TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 52.5 0.0525 E12.5 retina GTCCTTCAGA (2) TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 24.5 0.0245 E14.5 retina GTCCTTCAGA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 54.6 0.0546 E16.5 retina TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 19.9 0.0199 E18.5 retina TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 61.8 0.0618 P0.5 retina TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTCTGCCCA 37.4 0.0374 P2.5 retina TATAAAAAAA (2) TATAAAATAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA TTTCTGCCCA 44.2 0.0442 P4.5 retina TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 53.4 0.0534 P6.5 retina TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 43.4 0.0434 P10.5 crx- retina GTCCTTCAGA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAGTTAA 18.7 0.0187 P10.5 crx+ retina GACTTCCTGT (3) TATAAAAAAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTCTGCCCA 26.9 0.0269 Adult retinal TCAAAAAAAA (2) TTTAAGTTAA 22.3 0.0223 ONL GACTTCCTGT (3) TATAAAAAAA (2) TATAAAATAA (2) TCAAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) TTTAAGTTAA 30.6 0.0306