Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29820	2310068C19Rik	RIKEN cDNA 2310068C19 gene	14		70205
Mm.29820	Bnip3l	BCL2/adenovirus E1B 19kDa-interacting protein 3-like	14	14 D1 (14 28.0 cM)	12177
Gene Ontology	apoptosis | integral to membrane | mitochondrion | regulation of apoptosis
Human Homolog	BNIP3L[BCL2/adenovirus E1B 19kDa interacting protein 3-like]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 7 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 117 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGAAAGGGG (3) AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGATGGTT TTTGGATGTT (5) 42.4 0.0424 Cb medulloblastoma AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGATGGTT TTTGGATGTT (5) 32.2 0.0322 P8 GC+1d culture AAGAAAGGGG (3) AATCTTCAAG AATGATGCAG (2) ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) GTGTTAATAG (2) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 67.1 0.0671 P8 GC+SHH+1d culture AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGATGGTT TTTGGATGTT (5) 71.4 0.0714 3T3 fibroblasts CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA 10.5 0.0105 E15 cortex AATCTTCAAG AATGATGCAG (2) TAACTTGTAG (6) 24.6 0.0246 P1 cortex AATGATGCAG (2) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 18 0.018 Hypothalamus CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 48.9 0.0489 E12.5 retina AATCTTCAAG AATGATGCAG (2) ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) GTGTTAATAG (2) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA 63.9 0.0639 E14.5 retina AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) GTGTTAATAG (2) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 67.4 0.0674 E16.5 retina AATGATGCAG (2) ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGATGGTT TTTGGATGTT (5) 81.4 0.0814 E18.5 retina AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 90.9 0.0909 P0.5 retina AATGATGCAG (2) ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 53.1 0.0531 P2.5 retina AATGATGCAG (2) ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 65.3 0.0653 P4.5 retina AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) GTGTTAATAG (2) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 97.1 0.0971 P6.5 retina AAGAAAGGGG (3) AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 58.3 0.0583 P10.5 crx- retina ACTTTGTTTC (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TCACTCTGGC (3) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 53.9 0.0539 P10.5 crx+ retina AATGATGCAG (2) CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 57.7 0.0577 Adult retinal CAGTTACATC (5) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 18.6 0.0186 ONL AATGATGCAG (2) TAACTTGTAG (6) TTGATGTTGA TTTGGATGTT (5) 22.9 0.0229