Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29965	2810454F19Rik	RIKEN cDNA 2810454F19 gene	15		72802
Mm.29965	2410104I19Rik	RIKEN cDNA 2410104I19 gene	15		67959
Human Homolog	SIAHBP1[fuse-binding protein-interacting repressor]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CACATCTGTA (3) GAGAAAACCA GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) TGCTCCTGCT (2) 21.1 0.0211 Cb medulloblastoma AACATCAAGG (2) CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 18.4 0.0184 P8 GC+1d culture CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 19.4 0.0194 P8 GC+SHH+1d culture CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GAGAAAACCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 18.8 0.0188 3T3 fibroblasts CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 28 0.028 E15 cortex GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GCTGCCCAGG (3) 14.7 0.0147 P1 cortex GCCTCAGAGA (2) 9.1 0.0091 Hypothalamus CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) TGCTCCTGCT (2) 21.6 0.0216 E12.5 retina GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 13.1 0.0131 E14.5 retina CTGCTGCTGT GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) 14.5 0.0145 E16.5 retina CTGCTGCTGT GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GCTGCCCAGG (3) GTGGACCCCA (6) 30.7 0.0307 E18.5 retina GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) 9.1 0.0091 P0.5 retina CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 21.7 0.0217 P2.5 retina CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 14.2 0.0142 P4.5 retina CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 21.9 0.0219 P6.5 retina GAGAATTCCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 18.4 0.0184 P10.5 crx- retina CACATCTGTA (3) CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GCTGCCCAGG (3) 33.5 0.0335 P10.5 crx+ retina AACATCAAGG (2) CTGCTGCTGT GAGAAAACCA GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 38.4 0.0384 Adult retinal CTGCTGCTGT GCCTCAGAGA (2) GCTGCCCAGG (3) GTGGACCCCA (6) TGCTCCTGCT (2) 24.2 0.0242 ONL AACATCAAGG (2) CACATCTGTA (3) GCCTCAGAGA (2) GTGGACCCCA (6) 15.3 0.0153