Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.30179	1110002M09Rik	RIKEN cDNA 1110002M09 gene	1		66915
Human Homolog	LOC150678[helicase/primase complex protein]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CAAAATTTTT TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTCTGGAGT TGTGTGATGT (3) 31 0.031 Cb medulloblastoma AACGGCCTTC (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 11.5 0.0115 P8 GC+1d culture CTGTGGGATG (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 33.1 0.0331 P8 GC+SHH+1d culture CTGTGGGATG (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 22.2 0.0222 3T3 fibroblasts AACGGCCTTC (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 17.5 0.0175 E15 cortex TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 19.7 0.0197 P1 cortex TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 36.3 0.0363 Hypothalamus AACGGCCTTC (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 16.3 0.0163 E12.5 retina GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 28.2 0.0282 E14.5 retina CAGAATTTTT GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 16.4 0.0164 E16.5 retina AACGGCCTTC (2) CTGTGGGATG (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 32.5 0.0325 E18.5 retina CAGAATTTTT GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 23.6 0.0236 P0.5 retina GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTCTGGAGT TGTGTGATGT (3) 23.6 0.0236 P2.5 retina GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 26.4 0.0264 P4.5 retina GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT 11.9 0.0119 P6.5 retina TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTCTGGAGT TGTGTGATGT (3) 26.7 0.0267 P10.5 crx- retina GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 67 0.067 P10.5 crx+ retina CAAAATTTTT GAACAGTGTG (2) TCTGTGATAT (3) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 28.7 0.0287 Adult retinal CAAAATTTTT GAACAGTGTG (2) TCTGTGATGT TGTGTGATGT (3) 20.5 0.0205 ONL CTGTGGGATG (2) GAACAGTGTG (2) TCTGTGATGT 9.5 0.0095