Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.302938 Ddx3yDEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 3, Y-linked Y  Y 2.07 cM  26900 
 Mm.302938 D1Pas1-rs1DNA segment, Chr 1, Pasteur Institute 1, related sequence 1 1    13129 
 Gene Ontology ATP binding | ATP dependent helicase activity | helicase activity | nucleic acid binding | RNA binding
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 75 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGTTTAAA
CTAGTGTTGG (3)
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
21.20.0212
Cb medulloblastomaAAAGTTTAAA
CTAGTGTTGG (3)
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
48.50.0485
P8 GC+1d cultureGAACTTTAAG (4)
GACCATAGAA (3)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
18.30.0183
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGTTTAAA
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
GACCATAGAA (3)
TGCAATAAAA (5)
19.90.0199
3T3 fibroblastsTGCAATAAAA (5)
3.50.0035
E15 cortexTGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
9.80.0098
P1 cortexGAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
13.60.0136
HypothalamusCTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
10.80.0108
E12.5 retinaTGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
11.30.0113
E14.5 retinaATACTTGCAG (2)
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
21.90.0219
E16.5 retinaATACTTGCAG (2)
CTTGAACTGT (2)
TGCAATAAAA (5)
12.60.0126
E18.5 retinaCTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
290.029
P0.5 retinaCTAGTGTTGG (3)
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
GACCATAGAA (3)
TGCAATAAAA (5)
27.60.0276
P2.5 retinaATACTTGCAG (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
21.20.0212
P4.5 retinaCTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
GACCATAGAA (3)
TGCAATAAAA (5)
29.80.0298
P6.5 retinaATACTTGCAG (2)
CTAGTGTTGG (3)
TGCAATAAAA (5)
23.30.0233
P10.5 crx- retinaAAAGTTTAAA
ATACTTGCAG (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
260.026
P10.5 crx+ retinaATACTTGCAG (2)
CTTGAACTGT (2)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
34.50.0345
Adult retinalAAAGTTTAAA
CTTGAACTGT (2)
TGCAATAAAA (5)
11.20.0112
ONLAAAGTTTAAA
ATACTTGCAG (2)
CTAGTGTTGG (3)
GAACTTTAAG (4)
TGCAATAAAA (5)
TTTTAAATTT (3)
19.10.0191