Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.30524	F630025I20Rik	RIKEN cDNA F630025I20 gene	11		104757
Mm.30524	4732496G21Rik	RIKEN cDNA 4732496G21 gene	11		320162
Human Homolog	LOC90799[hypothetical protein BC009518]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 59 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACATATTCAG (2) CACTGGCCAG (2) CCTTTAATTC (3) TTAAAATTTA (6) 6.4 0.0064 Cb medulloblastoma CCTTTAATTC (3) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture TTAAAATTTA (6) TTGATTATTA 3.4 0.0034 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAAAAA (4) CCTTTAATTC (3) GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) 14 0.014 3T3 fibroblasts CCTTTAATTC (3) 7 0.007 P1 cortex CCTTTAATTC (3) 13.6 0.0136 Hypothalamus ACATATTCAG (2) CCTTTAAAAA (4) GCCCTCCTCC (2) GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) 9 0.009 E12.5 retina CCTTTAATTC (3) TTAAAATTTA (6) 5.7 0.0057 E14.5 retina CCTTTAATTC (3) TTAAAATTTA (6) 9.1 0.0091 E16.5 retina CACTGGCCAG (2) CCTTTAATTC (3) GCCCTCCTCC (2) TTAAAATTTA (6) 12.6 0.0126 E18.5 retina CCTTTAAAAA (4) CCTTTAATTC (3) TTAAAATTTA (6) 18.1 0.0181 P0.5 retina CCTTTAATTC (3) GTGTAAGAAG TTGATTATTA 9.9 0.0099 P2.5 retina CACTGGCCAG (2) CCTTTAAAAA (4) CCTTTAATTC (3) TTAAAATTTA (6) 12.4 0.0124 P4.5 retina CCTTTAATTC (3) GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) TTGATTATTA 23.8 0.0238 P6.5 retina ACATATTCAG (2) CCTTTAAAAA (4) CCTTTAATTC (3) GGCGAGAAAT GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) 20.1 0.0201 P10.5 crx- retina ACATATTCAG (2) CCTTTAATTC (3) GGCGAGAAAT GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) TTGATTATTA 13.2 0.0132 P10.5 crx+ retina TTAAAATTTA (6) 3.8 0.0038 Adult retinal CCTTTAATTC (3) GCCCTCCTCC (2) GGCGAGAAAT GTGTAAGAAG TTAAAATTTA (6) 11.3 0.0113 ONL CCTTTAATTC (3) 3.8 0.0038