Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.306770	Mylc2b	myosin light chain, regulatory B	17		67938
Gene Ontology	apical part of cell | cytoskeleton | cytoskeleton organization and biogenesis
Human Homolog	MRCL3[myosin regulatory light chain MRCL3]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 88 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 45.7 0.0457 Cb medulloblastoma GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 41.6 0.0416 P8 GC+1d culture CATTGGGCTC GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) TTGTAAATTG 61.6 0.0616 P8 GC+SHH+1d culture CATTGGGCTC CCCTAGCTTT CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAACCA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) TTGTAAATTG 45.7 0.0457 3T3 fibroblasts GCCGCTAGGC (2) TGCTTTATCA (2) 31.5 0.0315 E15 cortex GCCGCTAGGC (2) GGCGACCGCT (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 54.4 0.0544 P1 cortex GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 31.7 0.0317 Hypothalamus CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) GGCGACCGCT (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) 36.1 0.0361 E12.5 retina GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 18.8 0.0188 E14.5 retina CCCTAGCTTT GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAACCA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 29 0.029 E16.5 retina CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 50.7 0.0507 E18.5 retina CCCTAGCTTT CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAATCA (2) 45.4 0.0454 P0.5 retina CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 31.4 0.0314 P2.5 retina CATTGGGCTC CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 30 0.03 P4.5 retina CATTGGGCTC CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) 43.7 0.0437 P6.5 retina GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 39.9 0.0399 P10.5 crx- retina GCCGCTAGGC (2) TGCATAACCA TGCATAATCA (2) 22.4 0.0224 P10.5 crx+ retina CATTGGGCTC CTAAGTGACA GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) 42.2 0.0422 Adult retinal GCCGCTAGGC (2) TGCATAATCA (2) TGCTTTATCA (2) 29.7 0.0297 ONL GCCGCTAGGC (2) TACCTTATAA TGCATAACCA TGCATAATCA (2) TTGTAAATTG 21 0.021