| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 6.5 | 0.0065 |
| Cb medulloblastoma | GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TTCTGGCATC
| 6.9 | 0.0069 |
| P8 GC+1d culture | GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 10.2 | 0.0102 |
| P8 GC+SHH+1d culture | GGTGGTTCAA TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 8.3 | 0.0083 |
| 3T3 fibroblasts | GGTGCTCCCG
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | GGTGCTCCCG TTCTGGCATC
| 9.8 | 0.0098 |
| Hypothalamus | TTCTGGCATC
| 1.8 | 0.0018 |
| E12.5 retina | GATGTGTTGC GGTGCTCCCG TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 9.5 | 0.0095 |
| E14.5 retina | GGTGCTCCCG TTCTGGCATC
| 5.4 | 0.0054 |
| E16.5 retina | GAAAAAGTCT (2) GGTGGTTCAA TTCTGGCATC
| 12.7 | 0.0127 |
| E18.5 retina | GAAAAAGTCT (2) GATGTGTTGC GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TTCTGGCATC
| 12.7 | 0.0127 |
| P0.5 retina | GATGTGTTGC GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TAATGGTGCT TTTGTCACCT
| 17.8 | 0.0178 |
| P2.5 retina | GGTGGTTCAA
| 3.5 | 0.0035 |
| P4.5 retina | GAAAAAGTCT (2) GGTGCTCCCG TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 12 | 0.012 |
| P6.5 retina | GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TTCTGGCATC
| 8.4 | 0.0084 |
| P10.5 crx- retina | GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TAATGGTGCT TTCTGGCATC
| 11.2 | 0.0112 |
| P10.5 crx+ retina | GGTGGTTCAA TTCTGGCATC
| 5.7 | 0.0057 |
| Adult retinal | GGTGCTCCCG
| 3.7 | 0.0037 |
| ONL | GGTGCTCCCG GGTGGTTCAA TTTGTCACCT
| 11.4 | 0.0114 |