Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.319011	Pftk1	PFTAIRE protein kinase 1	5	5 0.0 cM	18647
Gene Ontology	ATP binding | electron transport | kinase activity | nucleus | protein amino acid phosphorylation | protein kinase activity | protein serine/threonine kinase activity | protein-tyrosine kinase activity | transferase activity
Human Homolog	PFTK1[PFTAIRE protein kinase 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 58 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) GACAGCCTCA (5) 6.5 0.0065 Cb medulloblastoma TTGCATATGT 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TTGAAGCATA (2) 12.6 0.0126 P8 GC+SHH+1d culture ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) GACAGCCTCA (5) TTTGAAATGG 8.3 0.0083 E15 cortex ATATGGAATA 4.9 0.0049 P1 cortex CAAGGATGAA 4.5 0.0045 Hypothalamus ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TGTCTTGTCC TTGAAGCATA (2) TTTGAAATGG 21.7 0.0217 E12.5 retina ATATGGAATA TTTGAAATGG 9.4 0.0094 E14.5 retina ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TTGCATATGT 16.4 0.0164 E16.5 retina ATATGGAATA CAAGGATGAA TTGAAGCATA (2) TTGCATATGT 10.8 0.0108 E18.5 retina ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TTGAAGCATA (2) TTGCATATGT 14.5 0.0145 P0.5 retina ATATGGAATA CAAGGATGAA TGTCTTGTCC TTGAAGCATA (2) TTGCATATGT 11.9 0.0119 P2.5 retina ATATGGAATA CAAGGATGAA CGCAGATTAT (2) TTGAAGCATA (2) 23 0.023 P4.5 retina ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TTGAAGCATA (2) 8 0.008 P6.5 retina ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TTGAAGCATA (2) 13.4 0.0134 P10.5 crx- retina ATATGGAATA TTGAAGCATA (2) 11.1 0.0111 P10.5 crx+ retina ATATGGAATA CGCAGATTAT (2) TGTCTTGTCC TTGAAGCATA (2) 15.3 0.0153 Adult retinal ATATGGAATA CAAGGATGAA TTGAAGCATA (2) 7.5 0.0075 ONL ATATGGAATA GACAGCCTCA (5) TTTGAAATGG 5.7 0.0057