Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.319660 Hmgn2high mobility group nucleosomal binding domain 2 4  4 D3 (4 62.2 cM)  15331 
 Gene Ontology chromatin | DNA binding | DNA packaging | nucleus
 Human Homolog HMGN2[high-mobility group nucleosomal binding domain 2]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 8 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 133 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATCCTTCCCC (2)
ATCGTTTATG
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
TGTCAGTAAC
194.20.1942
Cb medulloblastomaATTGTTTATG (3)
CCAAAAGAAA
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAT
18.40.0184
P8 GC+1d cultureATCCTTCCCC (2)
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAT
TGTCAGTAAC
107.20.1072
P8 GC+SHH+1d cultureATCCTTCCCC (2)
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GCTATTACAA (2)
GGCAGACAAT
TCCTGCCTGA
TGTCAGTAAC
234.10.2341
3T3 fibroblastsATTGTTTATG (3)
GGCAGACAAT
140.014
E15 cortexATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
TCCTGCCTGA
TGTCAGTAAC
34.50.0345
P1 cortexATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GCTATTACAA (2)
36.20.0362
HypothalamusATTGTTTATG (3)
GCCTCTGCTG (2)
GTATTTCAGG
TGTCAGTAAC
19.90.0199
E12.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
GTATTTCAGG
TGTCAGTAAC
193.50.1935
E14.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
GTATTTCAGG
265.90.2659
E16.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATCGTTTATG
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
GGCAGACAAT
TCCTGCCTGA
TGTCAGTAAC
206.30.2063
E18.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATCGTTTATG
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAT
GTATTTCAGG
TCCTGCCTGA
416.50.4165
P0.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
TGTCAGTAAC
2670.267
P2.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATCGTTTATG
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
TCCTGCCTGA
385.50.3855
P4.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
GCTATTACAA (2)
GGCAGACAAT
GTATTTCAGG
459.60.4596
P6.5 retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GCTATTACAA (2)
GGCAGACAAA
GGCAGACAAT
TCCTGCCTGA
TGTCAGTAAC
506.90.5069
P10.5 crx- retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGGTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAT
TGTCAGTAAC
2100.21
P10.5 crx+ retinaATCCTTCCCC (2)
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAA
GGCAGACAAT
GTATTTCAGG
TCCTGCCTGA
TGTCAGTAAC
236.40.2364
Adult retinalATCCTTCCCC (2)
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GCCTCTGCTG (2)
GGCAGACAAT
TGTCAGTAAC
540.054
ONLATCCTTCCCC (2)
ATCGTTTATG
ATTGTTTATG (3)
CCCAAAAAAA (2)
CCCAAAAGAA
GGCAGACAAT
TCCTGCCTGA
120.60.1206