Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.32368 A630036P20RikRIKEN cDNA A630036P20 gene 5    320666 
 Mm.32368 Ccm1cerebral cavernous malformations 1 5    79264 
 Gene Ontology protein binding | small GTPase regulatory/interacting protein activity
 Human Homolog CCM1[cerebral cavernous malformations 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGCTTTATA
ATTCCGAATT (2)
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
TTGGTTTTCA (2)
12.90.0129
Cb medulloblastomaATGCTTTATA
ATTTGAATAA (3)
TGACAAAATT (2)
TTTGGTGTGT (2)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureATTTGAATAA (3)
GATTTCAAAA (2)
TAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
10.30.0103
P8 GC+SHH+1d cultureTAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
5.80.0058
P1 cortexATTTGAATAA (3)
TGACAAAATT (2)
90.009
HypothalamusAAATTAATTT (2)
ATTTGAATAA (3)
TTGGTTTTCA (2)
TTTGGTGTGT (2)
10.80.0108
E12.5 retinaAACTTCCTCA (2)
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
9.50.0095
E14.5 retinaTAGGCAGACT
TTTGGTGTGT (2)
5.40.0054
E16.5 retinaATGCTTTATA
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
90.009
E18.5 retinaATGCTTTATA
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
10.90.0109
P0.5 retinaAACTTCCTCA (2)
ATTTGAATAA (3)
GATTTCAAAA (2)
TAGGCAGACT
TTTGGTGTGT (2)
11.90.0119
P2.5 retinaATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
17.60.0176
P4.5 retinaATTCCGAATT (2)
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
9.90.0099
P6.5 retinaAAATTAATTT (2)
AACTTCCTCA (2)
ATTCCGAATT (2)
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTGCTGTACC (3)
TTGGTTTTCA (2)
21.70.0217
P10.5 crx- retinaAAATTAATTT (2)
ATGCTTTATA
ATTTGAATAA (3)
GATTTCAAAA (2)
TAGGCAGACT
20.60.0206
P10.5 crx+ retinaAACTTCCTCA (2)
ATGCTTTATA
ATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTGGTTTTCA (2)
TTTGGTGTGT (2)
15.20.0152
Adult retinalATTTGAATAA (3)
TAGGCAGACT
TTTGGTGTGT (2)
5.70.0057
ONLATGCTTTATA
ATTCCGAATT (2)
ATTTGAATAA (3)
TGACAAAATT (2)
11.40.0114