Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.32373	3110057O12Rik	RIKEN cDNA 3110057O12 gene	3		269423
Gene Ontology	DNA binding | hydrolase activity
Human Homolog	FLJ21106[hypothetical protein FLJ21106]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG GTTTATTAAA (2) 9.7 0.0097 Cb medulloblastoma CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) 25.4 0.0254 P8 GC+1d culture GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 9.1 0.0091 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 28.2 0.0282 3T3 fibroblasts CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) 28 0.028 E15 cortex GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG 19.7 0.0197 P1 cortex CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) TTTTATTAAA (2) 22.6 0.0226 Hypothalamus GGCCAGTTGG (2) GTAACTAACT GTTTATTAAA (2) 12.6 0.0126 E12.5 retina CCTTTAATTC (3) CCTTTTATCC (2) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 15.1 0.0151 E14.5 retina CCTTTAATTC (3) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 10.9 0.0109 E16.5 retina CCTTTAATTC (3) CCTTTTATCC (2) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 21.6 0.0216 E18.5 retina CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 10.8 0.0108 P0.5 retina CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) 17.7 0.0177 P2.5 retina CCTTTAATTC (3) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 10.6 0.0106 P4.5 retina CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 23.8 0.0238 P6.5 retina CCTTTAATTC (3) CCTTTTATCC (2) GGCCAGTTGG (2) TTTTATTAAA (2) 16.7 0.0167 P10.5 crx- retina CCTTTAATTC (3) GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG GTTTATTAAA (2) TTTTATTAAA (2) 22.5 0.0225 P10.5 crx+ retina GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG TTTTATTAAA (2) 21.1 0.0211 Adult retinal CCTTTAATTC (3) CCTTTTATCC (2) GGCCAGTTGG (2) GGCCAGTTTG 13.1 0.0131 ONL CCTTTAATTC (3) CCTTTTATCC (2) 7.6 0.0076