Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.325657 AI848615expressed sequence AI848615 16    106274 
 Mm.325657 A2bp1ataxin 2 binding protein 1 16  16 7.2 cM  268859 
 Mm.325657 R74919expressed sequence R74919 16    98046 
 Mm.325657 1700123O21RikRIKEN cDNA 1700123O21 gene 16  16 4.6 cM  68238 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 46 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTCAGAGGTGT (5)
1.60.0016
Cb medulloblastomaTGCAGAGATG (2)
TTAGCAACTC (4)
36.90.0369
P8 GC+1d cultureTGCAGAGATG (2)
TGGATCATCA (3)
TTAGCAACTC (4)
13.70.0137
P8 GC+SHH+1d cultureTGCAGAGATG (2)
TTAGCAACTC (4)
70.007
E15 cortexGGTCTTCCTG (4)
4.90.0049
P1 cortexGGTCTTCCTG (4)
TGCAGAGATG (2)
TTAGCAACTC (4)
22.60.0226
HypothalamusAAGCTACTGG (4)
GCCTCAGCCT (2)
GGTCTTCCTG (4)
TCAGAGGTGT (5)
TGCAGAGATG (2)
TGGATCATCA (3)
TTAGCAACTC (4)
32.50.0325
E12.5 retinaTGCAGAGATG (2)
1.90.0019
E16.5 retinaAAGCTACTGG (4)
AATTATGGAA (5)
GCCTCAGCCT (2)
TGGATCATCA (3)
TTAGCAACTC (4)
10.80.0108
E18.5 retinaAAGCTACTGG (4)
TTAGCAACTC (4)
5.40.0054
P0.5 retinaTGGATCATCA (3)
5.90.0059
P2.5 retinaAATTATGGAA (5)
TTAGCAACTC (4)
3.60.0036
P4.5 retinaTCAGAGGTGT (5)
TGGATCATCA (3)
TTAGCAACTC (4)
80.008
P6.5 retinaTGGATCATCA (3)
TTAGCAACTC (4)
50.005
P10.5 crx- retinaAATTATGGAA (5)
GCCTCAGCCT (2)
TCAGAGGTGT (5)
TGCAGAGATG (2)
TTAGCAACTC (4)
150.015
P10.5 crx+ retinaTGCAGAGATG (2)
TTAGCAACTC (4)
9.60.0096
Adult retinalGGTCTTCCTG (4)
TTAGCAACTC (4)
3.80.0038
ONLGGTCTTCCTG (4)
TGCAGAGATG (2)
5.70.0057