Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.328846 Rps2ribosomal protein S2 X    16898 
 Mm.328846 Pde6aphosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha 18  18 31.0 cM  225600 
 Gene Ontology 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity | catalytic activity | hydrolase activity | signal transduction | vision
 Human Homolog PDE6A[phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 112 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGATCAAGT (2)
CAAGGGTGAC (4)
CAAGGTGACA (4)
CTGCTGTGGC (2)
GCAAGGGTGA (3)
GGCAACTTTG (6)
74.90.0749
Cb medulloblastomaAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
370.037
P8 GC+1d cultureAAGATCAAGT (2)
CAAGGGTGAC (4)
CAAGGTGACA (4)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
GGCAACTTTG (6)
TCCTTAACCA
TGGCTCTGTG
62.70.0627
P8 GC+SHH+1d cultureCAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
TGGCTCTGTG
TGGTACACAG
TTCAGCTTTG (2)
86.70.0867
3T3 fibroblastsCAAGGTGACA (4)
CAGGTTGACA (2)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
567.70.5677
E15 cortexAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
TGGTACACAG
840.084
P1 cortexCAAGGTGACA (4)
CAGGTTGACA (2)
CTGCTGTGGC (2)
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
1180.118
HypothalamusAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
TGGTACACAG
37.90.0379
E12.5 retinaCAAGGCGACA (2)
CAAGGTGACA (4)
CAGGTTGACA (2)
CCAGTGCAGA
CTGCTGTGGC (2)
GCAAGGGTGA (3)
GTGGTGGCTC (2)
TGGCTCTGTG
TGGTACACAG
159.70.1597
E14.5 retinaAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
61.90.0619
E16.5 retinaAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
TGGCTCTGTG
63.40.0634
E18.5 retinaCAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
GGCAACTTTG (6)
TGGCTCTGTG
43.70.0437
P0.5 retinaCAAGGCGACA (2)
CAAGGTGACA (4)
CAAGGTGACC (4)
GCAAGGGTGA (3)
GGCAACTTTG (6)
TGGCTCTGTG
145.30.1453
P2.5 retinaCAAGGTGACA (4)
CAAGGTGACC (4)
CAGGTTGACA (2)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TGGCTCTGTG
51.20.0512
P4.5 retinaCAAGGGTGAC (4)
CAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
TGGCTCTGTG
TTCAGCTTTG (2)
41.60.0416
P6.5 retinaCAAGGTGACA (4)
GCAAGGGTGA (3)
GTGGTGGCTC (2)
TGGCTCTGTG
TGGTACACAG
60.20.0602
P10.5 crx- retinaAAGATCAAGT (2)
CAAGGTGACA (4)
CTGCTGTGGC (2)
GCAAGGGTGA (3)
70.70.0707
P10.5 crx+ retinaCAAGGTGACA (4)
CAGGTTGACA (2)
GCAAGGGTGA (3)
GTGGTGGCTC (2)
TGGCTCTGTG
55.70.0557
Adult retinalCAAGGTGACA (4)
CAAGGTGACC (4)
CAGGTTGACA (2)
GCAAGGGTGA (3)
GGCAACTTTG (6)
TGGCTCTGTG
57.40.0574
ONLCAAGGTGACA (4)
CCAGTGCAGA
GCAAGGGTGA (3)
TCCTTAACCA
TGGCTCTGTG
TGGTACACAG
TTCAGCTTTG (2)
36.30.0363