| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library | 
| P8 Cb GC | CAGCTTTTTT (2) CGGTCGGGTG
 CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAGGC
 CTAATAGAGC
 CTGGAAGGGA
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTAAAAAAAG (2)
 GTTCCCTGGC
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 285.4 | 0.2854 | 
| Cb medulloblastoma | CAAATAAAGC (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAAGG
 GCAGGGTGGC (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 173.3 | 0.1733 | 
| P8 GC+1d culture | CAGCTTTTTT (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAAGG
 CTAATAAGAG
 CTAATAGAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTTCCCTGGC
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 255.5 | 0.2555 | 
| P8 GC+SHH+1d culture | ACTAGTGCTT (4) ATAATAAAGC
 CAGCTTTTTT (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAGAG
 CTAATAAGGC
 CTAATAGAGC
 CTGATAAAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTTCCCTGGC
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 298.8 | 0.2988 | 
| 3T3 fibroblasts | CTAATAAAAG (3) CTAATAAAGC (2)
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 
 | 112.1 | 0.1121 | 
| E15 cortex | CAGCTTTTTT (2) CGGTCGGGTG
 CTAATAAAGC (2)
 CTGGGAGGTA (2)
 TGGCCTCCCT (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 93.9 | 0.0939 | 
| P1 cortex | CTAATAAAAG (3) CTAATAAAGC (2)
 CTGGAAGGGA
 GCAGGGTGGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 
 | 131.6 | 0.1316 | 
| Hypothalamus | CAAATAAAGC (2) CGGTCGGGTG
 CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAAGG
 CTAATAAGAG
 CTAATAAGGC
 GCAGGGTGGC (2)
 GTAAAAAAAG (2)
 GTAATAAAGC (2)
 TGGCCTCCCT (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 286.1 | 0.2861 | 
| E12.5 retina | ACTAGTGCTT (4) CAGCTTTTTT (2)
 CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAAGG
 CTAATAAGAG
 CTAATAAGGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTAAAAAAAG (2)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 315.7 | 0.3157 | 
| E14.5 retina | CAGCTTTTTT (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGGCCTCCCT (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 254.9 | 0.2549 | 
| E16.5 retina | ATAATAAAGC CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTGATAAAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 278.9 | 0.2789 | 
| E18.5 retina | CTAATAAAAC (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAATG
 CTAATAAGAG
 CTGATAAAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 
 | 432.9 | 0.4329 | 
| P0.5 retina | ATAATAAAGC CGGTCGGGTG
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAGAG
 CTAATAAGGC
 CTGGGAGGTA (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 210.1 | 0.2101 | 
| P2.5 retina | ATAATAAAGC CGGTCGGGTG
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAATG
 CTAATAAGAG
 CTGATAAAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTAATAAAGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 304.8 | 0.3048 | 
| P4.5 retina | ACTAGTGCTT (4) CAAATAAAGC (2)
 CAGCTTTTTT (2)
 CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAGAG
 CTAATAAGGC
 CTAATAGAGC
 CTGATAAAGC
 CTGGAAGGGA
 CTGGGAGGTA (2)
 GTAATAAAGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 281.6 | 0.2816 | 
| P6.5 retina | CAGCTTTTTT (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTGATAAAGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 GTAATAAAGC (2)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 245.2 | 0.2452 | 
| P10.5 crx- retina | CAAATAAAGC (2) CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 CTAATAAGGC
 CTGGGAGGTA (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 143.2 | 0.1432 | 
| P10.5 crx+ retina | CAAATAAAGC (2) CTAATAAAAC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 167.1 | 0.1671 | 
| Adult retinal | ATAATAAAGC CAAATAAAGC (2)
 CTAATAAAAG (3)
 CTAATAAAGC (2)
 GCAGGGTGGC (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 TTAATAAAGC (2)
 
 | 68.6 | 0.0686 | 
| ONL | CTAATAAAAG (3) CTAATAAAGC (2)
 CTGATAAAGC
 TCTGTGCCCA (2)
 TGTGTGCCCA (3)
 
 | 67 | 0.067 |