Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.332522 Wdfy3WD repeat and FYVE domain containing 3 5  5 54.0 cM  72145 
 Mm.332522 D5Ertd66eDNA segment, Chr 5, ERATO Doi 66, expressed 5  5 54.0 cM  52075 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 74 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAAATATGTT (6)
CTGTGGATGA
GGTCATATGG (2)
GTAAATGCAA (3)
24.40.0244
Cb medulloblastomaAGACTTCAAA
GTAAATGCAA (3)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureAGACTTCAAA
AGAGCCTGAG
CAAATATGTT (6)
CAACAAGTAA (2)
CTGTGGATGA
CTGTGGGATG (2)
GTAAATGCAA (3)
TATGTGAAAA (2)
21.60.0216
P8 GC+SHH+1d cultureAGACTTCAAA
CAAATATGTT (6)
CTGTGGATGA
CTGTGGGATG (2)
GTAAATGCAA (3)
TATATTTTTG (3)
15.30.0153
3T3 fibroblastsAGAGCCTGAG
3.50.0035
E15 cortexCAAATATGTT (6)
24.70.0247
P1 cortexCAAATATGTT (6)
9.10.0091
HypothalamusAGACTTCAAA
AGAGCCTGAG
GTAAATGCAA (3)
TGGTACAACA (2)
7.20.0072
E12.5 retinaAGAGCCTGAG
CAAATATGTT (6)
GTAAATGCAA (3)
13.20.0132
E14.5 retinaCTGTGGATGA
GTAAATGCAA (3)
GTTTCCCCTC (2)
TATATTTTTG (3)
TATGTGAAAA (2)
90.009
E16.5 retinaAGAGCCTGAG
CAAATATGTT (6)
CTGTGGGATG (2)
GTAAATGCAA (3)
TATGTGAAAA (2)
14.40.0144
E18.5 retinaAGAGCCTGAG
CAAATATGTT (6)
GTTTCCCCTC (2)
TATATTTTTG (3)
90.009
P0.5 retinaCTGTGGATGA
GTAAATGCAA (3)
5.90.0059
P2.5 retinaCAACAAGTAA (2)
GTAAATGCAA (3)
TATGTGAAAA (2)
14.20.0142
P4.5 retinaGTAAATGCAA (3)
9.90.0099
P6.5 retinaCAACAAGTAA (2)
CTGTGGATGA
GTAAATGCAA (3)
10.10.0101
P10.5 crx- retinaAGACTTCAAA
AGAGCCTGAG
CAAATATGTT (6)
GTAAATGCAA (3)
13.10.0131
P10.5 crx+ retinaAGAGCCTGAG
GTAAATGCAA (3)
GTTTCCCCTC (2)
7.60.0076
Adult retinalCAACAAGTAA (2)
GGTCATATGG (2)
GTAAATGCAA (3)
GTTTCCCCTC (2)
TATGTGAAAA (2)
TGGTACAACA (2)
16.80.0168
ONLAGAGCCTGAG
CAACAAGTAA (2)
CTGTGGGATG (2)
GGTCATATGG (2)
GTAAATGCAA (3)
GTTTCCCCTC (2)
TATATTTTTG (3)
TATGTGAAAA (2)
17.10.0171