Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.332901 C230037E05RikRIKEN cDNA C230037E05 gene 6    30910 
 Mm.332901 2210017G18RikRIKEN cDNA 2210017G18 gene 6    70386 
 Mm.332901 Ppp1r9aprotein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9A 6    243725 
 Mm.332901 2810430P21RikRIKEN cDNA 2810430P21 gene 6    72734 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 60 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCTACTGAGG
GGAGAAACAG (4)
3.20.0032
Cb medulloblastomaCAGTTACAGA (3)
GGAGAAACAG (4)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureAAGTTGTCAC (4)
CAGTTACAGA (3)
GCTACTGAGG
4.50.0045
P8 GC+SHH+1d cultureAAATAACAAT (4)
CCACTTGTGT (4)
GCTACTGAGG
4.70.0047
E15 cortexAAATAACAAT (4)
CAAATGACCA (4)
9.80.0098
P1 cortexAAATAACAAT (4)
CACAATAGTG
GTTTAATGAA (5)
13.50.0135
HypothalamusCCACTTGTGT (4)
GCTACTGAGG
GGAGAAACAG (4)
5.40.0054
E12.5 retinaAAGTTGTCAC (4)
CAGTTACAGA (3)
GTTTAATGAA (5)
11.30.0113
E14.5 retinaCAAATGACCA (4)
GTTTAATGAA (5)
12.70.0127
E16.5 retinaAAATAACAAT (4)
GTTTAATGAA (5)
90.009
E18.5 retinaGGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
5.40.0054
P0.5 retinaGCTACTGAGG
GGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
7.90.0079
P2.5 retinaCAAATGACCA (4)
GCTACTGAGG
GGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
10.70.0107
P4.5 retinaAAGTTGTCAC (4)
CAAATGACCA (4)
GTTTAATGAA (5)
15.90.0159
P6.5 retinaAAATAACAAT (4)
AAGTTGTCAC (4)
CCACTTGTGT (4)
GCTACTGAGG
GGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
13.50.0135
P10.5 crx- retinaAAATAACAAT (4)
CAGTTACAGA (3)
CCACTTGTGT (4)
GGAGAAACAG (4)
11.20.0112
P10.5 crx+ retinaCCACTTGTGT (4)
GGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
15.40.0154
Adult retinalAAATAACAAT (4)
CACAATAGTG
CAGTTACAGA (3)
CCACTTGTGT (4)
GCTACTGAGG
GTTTAATGAA (5)
13.20.0132
ONLAAATAACAAT (4)
CACAATAGTG
GGAGAAACAG (4)
GTTTAATGAA (5)
13.40.0134