Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.333233 D6Ertd318eDNA segment, Chr 6, ERATO Doi 318, expressed 6  6 38.0 cM  52316 
 Mm.333233 Rab7RAB7, member RAS oncogene family 6  6 38.5 cM  19349 
 Gene Ontology DNA binding | Golgi apparatus | GTP binding | intracellular protein transport | late endosome | protein transport | regulation of transcription, DNA-dependent | small GTPase mediated signal transduction | two-component signal transduction system (phosphorelay)
 Human Homolog RAB7[RAB7, member RAS oncogene family]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 121 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGCAGGGCC
CAGATTTGGG (3)
CTTCCTGGAG (2)
GAAAGCTTAC (3)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
GTCTCTGCCA
TACTATAAGA (3)
TTAATATAAT (2)
32.50.0325
Cb medulloblastomaATGCAGGGCC
CAGATCTGGG (2)
CAGGTCTGGG (3)
CCCACTGCAC (2)
GCTTGCTTCC (2)
TACTATAAGA (3)
39.20.0392
P8 GC+1d cultureAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
CAGGTCTGGG (3)
CTTCCTGGAG (2)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
TACTATAAGA (3)
TTAATATATG (2)
44.40.0444
P8 GC+SHH+1d cultureAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCC
CAGATTTGGG (3)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
TTAATATATG (2)
45.70.0457
3T3 fibroblastsATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
CCCACTGCAC (2)
CTTCCTGGAG (2)
GCTTGCTTCC (2)
GGCTTGATTC
GTCTCTGCCA
490.049
E15 cortexATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
CAGATCTGGG (2)
CAGATTTGGG (3)
GCTGCTTCCT
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
740.074
P1 cortexATGCAGGGCC
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTAC (5)
GCTTGCTTCC (2)
27.10.0271
HypothalamusATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
CAGATCTGGG (2)
CAGATTTGGG (3)
CAGGTCTGGG (3)
GAAAGCTTAC (3)
GCTTGCTTCC (2)
GGCTTGATTC
TACTATAAGA (3)
TTAATATATG (2)
27.10.0271
E12.5 retinaAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCC
CAGGTCTGGG (3)
CCCACTGCAC (2)
GCTGCTTCCT
GCTTGCTTCC (2)
TACTATAAGA (3)
24.50.0245
E14.5 retinaATGCAGGGCC
GCTTGCTTCC (2)
TACTATAAGA (3)
TGGAGCAGGC (2)
10.80.0108
E16.5 retinaAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCC
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTAC (5)
GCTTGCTTCC (2)
TTAATATAAT (2)
TTAATATATG (2)
37.90.0379
E18.5 retinaATGCAGGGCC
CTTCCTGGAG (2)
GAAAGCTTAC (3)
GCTTGCTTAC (5)
GCTTGCTTCC (2)
TGGAGCAGGC (2)
TTAATATATG (2)
32.70.0327
P0.5 retinaAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
GAAAGCTTAC (3)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
GTCTCTGCCA
33.50.0335
P2.5 retinaATGCAGGGCC
CAGATTTGGG (3)
GCTTGCTTCC (2)
TTAATATATG (2)
160.016
P4.5 retinaATGCAGGGCC
GCTTGCTTCC (2)
17.90.0179
P6.5 retinaAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCA (3)
ATGCAGGGCC
GAAAGCTTAC (3)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
GGCTTGATTC
38.40.0384
P10.5 crx- retinaATGCAGGGCC
CTTCCTGGAG (2)
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
260.026
P10.5 crx+ retinaAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCC
CCCACTGCAC (2)
GCTGCTTCCT
GCTTGCTGCC
GCTTGCTTCC (2)
TACTATAAGA (3)
TTAATATAAT (2)
49.80.0498
Adult retinalAAACAGAAGT (2)
ATGCAGGGCA (3)
CAGGTCTGGG (3)
CTTCCTGGAG (2)
GCTTGCTTCC (2)
24.30.0243
ONLGCTTGCTTCC (2)
1.90.0019