| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 8.2 | 0.0082 |
| Cb medulloblastoma | GAAACTGGAA
| 4.6 | 0.0046 |
| P8 GC+1d culture | ATGATAATGG (3) GAAACTGGAA
| 4.5 | 0.0045 |
| P8 GC+SHH+1d culture | ATGATAATGG (3)
| 3.5 | 0.0035 |
| 3T3 fibroblasts | GTCTATGCTG (2)
| 3.5 | 0.0035 |
| E15 cortex | ATGATAATGG (3)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 13.6 | 0.0136 |
| Hypothalamus | ATGATAATGG (3) GAAACTGGAA
| 21.7 | 0.0217 |
| E12.5 retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 7.5 | 0.0075 |
| E14.5 retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 20 | 0.02 |
| E16.5 retina | ATGATAATGG (3)
| 19.9 | 0.0199 |
| E18.5 retina | ATGATAATGG (3) GAAACTGGAA GTCTATGCTG (2)
| 18.2 | 0.0182 |
| P0.5 retina | ATGATAATGG (3) GAAACTGGAA GTCTATGCTG (2)
| 13.8 | 0.0138 |
| P2.5 retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 14 | 0.014 |
| P4.5 retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 11.9 | 0.0119 |
| P6.5 retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 10 | 0.01 |
| P10.5 crx- retina | ATGATAATGG (3) GTCTATGCTG (2)
| 3.8 | 0.0038 |
| P10.5 crx+ retina | ATGATAATGG (3) GAAACTGGAA GTCTATGCTG (2)
| 7.6 | 0.0076 |
| Adult retinal | ATGATAATGG (3)
| 9.3 | 0.0093 |
| ONL | ATGATAATGG (3)
| 11.5 | 0.0115 |