Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.342177 Igh-6immunoglobulin heavy chain 6 (heavy chain of IgM) 12  12 58.0 cM  16019 
 Mm.342177 Igh-VJ558immunoglobulin heavy chain (J558 family) 12  12 59.0 cM  16061 
 Human Homolog MGC27165[hypothetical protein MGC27165]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 105 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTAAAATGTGG (2)
TACTACTGTA (3)
TCTTCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
27.60.0276
Cb medulloblastomaGGCTGCCTGG (2)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTCCCCTC
13.80.0138
P8 GC+1d cultureGAAAGACCCT (2)
GAAATAAATA (4)
GACTCTAACC
GGCTGCCTGG (2)
GTGCCTGGTT (3)
TAAAATGTGG (2)
TATTACTGTA (2)
TCTTCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
78.60.0786
P8 GC+SHH+1d cultureCTGACTGTGA (2)
GAAAGACCCT (2)
GAAATAAATA (4)
GGGTACATTA (3)
GTGCCTGGTT (3)
TAAAATGTGG (2)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
TGCCCATCCC (2)
57.40.0574
3T3 fibroblastsCAGCTCAGTA (2)
CTGACTGTGA (2)
GAAAGACCCT (2)
140.014
E15 cortexGACCTCAGCA (2)
GGCTGCCTGG (2)
TCTTCCCCTC
19.70.0197
P1 cortexGAAAGACCCT (2)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
27.20.0272
HypothalamusCAGCTCAGTA (2)
GACCTCAGCA (2)
GGCTGCCTGG (2)
GTGCCTGGTT (3)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTCCCCCTC
TCTTCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
180.018
E12.5 retinaAGCCAGCAGT
CTGACTGTGA (2)
TAAAATGTGG (2)
TCTTGGCTTC (2)
7.60.0076
E14.5 retinaTATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
TGCCCATCCC (2)
90.009
E16.5 retinaCTGACTGTGA (2)
GAAAGACCCT (2)
TCTTCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
TGCCCATCCC (2)
27.10.0271
E18.5 retinaGAAATAAATA (4)
GACTCTAACC
TACTACTGTA (3)
TCTTGGCTTC (2)
90.009
P0.5 retinaGACTCTAACC
GGCTGCCTGG (2)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
11.80.0118
P2.5 retinaAGCCAGCAGT
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
26.40.0264
P4.5 retinaCTGACTGTGA (2)
GAAAGACCCT (2)
GACTCTAACC
GGGTACATTA (3)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
33.80.0338
P6.5 retinaCTGACTGTGA (2)
TAAAATGTGG (2)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
43.30.0433
P10.5 crx- retinaGACTCTAACC
GGGTACATTA (3)
TAAAATGTGG (2)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
TGCCCATCCC (2)
33.60.0336
P10.5 crx+ retinaGACTCTAACC
GGCTGCCTGG (2)
GGGTACATTA (3)
TACTACTGTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTCCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
24.90.0249
Adult retinalAGCCAGCAGT
TCTTCCCCTC
TCTTGGCTTC (2)
13.10.0131
ONLAGCCAGCAGT
GAAAGACCCT (2)
GGATACATAA (2)
GGCTGCCTGG (2)
GGGTACATTA (3)
TATTACTGTA (2)
TCTTGGCTTC (2)
15.20.0152