Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.34706 2900001A12RikRIKEN cDNA 2900001A12 gene 12    67107 
 Human Homolog ANKRD12[ankyrin repeat domain 12]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGTTTATTTT (2)
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TTAAAAAAAA (2)
112.60.1126
Cb medulloblastomaAGTTTATTTT (2)
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
279.70.2797
P8 GC+1d cultureATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GGGCCAGAAA
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
114.10.1141
P8 GC+SHH+1d cultureAGTTTATTTT (2)
ATGTTGGAAT
CATAAAAGTC
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
147.70.1477
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
GGGCCAGAAA
73.60.0736
E15 cortexCATAAAAGTC
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
TCTCAAAAGA (2)
TTAAAAAAAA (2)
128.40.1284
P1 cortexAGAAAGCTCT
ATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TCTCAAAAGA (2)
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
240.80.2408
HypothalamusAGTTTATTTT (2)
ATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
115.80.1158
E12.5 retinaCCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TTAAAAAAAA (2)
133.30.1333
E14.5 retinaATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
176.70.1767
E16.5 retinaAGTTTATTTT (2)
ATGTTGGAAT
CATAAAAGTC
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
119.40.1194
E18.5 retinaAGAAAGCTCT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
152.70.1527
P0.5 retinaAGTTTATTTT (2)
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
129.60.1296
P2.5 retinaAAAGATCCCT (3)
AGTTTATTTT (2)
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TCTCAAAAGA (2)
TTAAAAAAAA (2)
202.50.2025
P4.5 retinaCCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
148.70.1487
P6.5 retinaAGTTTATTTT (2)
ATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
TCTCAAAAGA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
140.10.1401
P10.5 crx- retinaAAAGATCCCT (3)
ATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
100.40.1004
P10.5 crx+ retinaATGTTGGAAT
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAACTTTAA
GGGCCAGAAA
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
101.80.1018
Adult retinalAAAGATCCCT (3)
CCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TCTCAAAAGA (2)
TGTTTGAGTT
TTAAAAAAAA (2)
TTATTTAATA
163.10.1631
ONLCCTTTAATCC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TTAAAAAAAA (2)
116.90.1169