| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library | 
| P8 Cb GC | CAGAATGGAA (2) GGCCAGCCCT (2)
 TAAACAGAAA
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 27.7 | 0.0277 | 
| Cb medulloblastoma | CAGAATGGAA (2) TAAACAGAAA
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 87.8 | 0.0878 | 
| P8 GC+1d culture | CACCAGAAGT CAGAATGGAA (2)
 GGCCAGCCCT (2)
 TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 68.5 | 0.0685 | 
| P8 GC+SHH+1d culture | CAGAATGGAA (2) CTGCTGCCAC (3)
 GGCCAGCCCT (2)
 GTATCTTGTA
 TAAACAGAAA
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 72.6 | 0.0726 | 
| 3T3 fibroblasts | CAGAATGGAA (2) 
 | 3.5 | 0.0035 | 
| E15 cortex | CTGCTGCCAC (3) TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 24.6 | 0.0246 | 
| P1 cortex | CAGAATGGAA (2) GTATCTTGTA
 TAAACAGAAA
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 31.6 | 0.0316 | 
| Hypothalamus | CAGAATGGAA (2) TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 83.2 | 0.0832 | 
| E12.5 retina | CAGAATGGAA (2) CTAGATGTCG
 TAAACAGAAA
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 33.8 | 0.0338 | 
| E14.5 retina | CAGAATGGAA (2) GGCAGGCTGA
 TAAACAGAAA
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 61.9 | 0.0619 | 
| E16.5 retina | CAGAATGGAA (2) GGCAGGCTGA
 GGCCAGCCCT (2)
 GTATCTTGTA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 39.8 | 0.0398 | 
| E18.5 retina | CAGAATGGAA (2) CTAGATGTCG
 CTGCTGCCAC (3)
 TAAACAGAAA
 TAAACAGAAT
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 78 | 0.078 | 
| P0.5 retina | CACCAGAAGT TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 31.6 | 0.0316 | 
| P2.5 retina | CACCAGAAGT CAGAATGGAA (2)
 TAAACAGAAA
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 31.7 | 0.0317 | 
| P4.5 retina | CAGAATGGAA (2) TAAACAGAAA
 TAAACAGAAT
 TGTGTGTGTA (2)
 TTAGAAGGAT (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 53.6 | 0.0536 | 
| P6.5 retina | CAGAATGGAA (2) TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 41.7 | 0.0417 | 
| P10.5 crx- retina | CAGAATGGAA (2) CTAGATGTCG
 GCACCCCAAA (2)
 TAAACAGAAA
 TGTGTGTGTA (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 50.3 | 0.0503 | 
| P10.5 crx+ retina | CAGAATGGAA (2) GCACCCCAAA (2)
 GGCAGGCTGA
 TAAACAGAAA
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 44.2 | 0.0442 | 
| Adult retinal | GCACCCCAAA (2) TGTGTGTGTA (2)
 TTGATTTTTT (4)
 
 | 35.2 | 0.0352 | 
| ONL | CAGAATGGAA (2) TAAACAGAAA
 TAAACAGAAT
 TGTGTGTGTA (2)
 TTGATTTTTT (4)
 TTGTTTATTG (2)
 
 | 32.5 | 0.0325 |