Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.3597	Tro	trophinin	X		56191
Gene Ontology	cell adhesion | cytoplasm | negative regulation of cell growth | nucleus | plasma membrane
Human Homolog	TRO[trophinin]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 45 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CAGCTTTGGT GAGCCAATGT 3.2 0.0032 Cb medulloblastoma CAGCTTTGGT GAGCCAATGT 6.9 0.0069 P8 GC+1d culture CAGCTTTGGT GAACCAATGT (2) GAGCCAATGT 11.4 0.0114 P8 GC+SHH+1d culture CAGCTTTGGT GAACCAATGT (2) GAGCCAATGT GGGCTCCAGC (2) TGGTTGATGG 14.1 0.0141 3T3 fibroblasts CAGCTTTGGT TGGTTGATGG 10.5 0.0105 P1 cortex GAGCCAATGT 9.1 0.0091 Hypothalamus AAAAAAATGC CAGCTTTGGT GAACCAATGT (2) GAGCCAATGT GGGCTCCAGC (2) 19.9 0.0199 E12.5 retina CAGCTTTGGT GAGCCAATGT 5.7 0.0057 E14.5 retina GAGCCAATGT TGGTTGATGG 7.3 0.0073 E16.5 retina CAGCTTTGGT TGGTTGATGG 3.6 0.0036 E18.5 retina AAAAAAATGC CAGCTTTGGT GAGCCAATGT 7.2 0.0072 P0.5 retina GAGCCAATGT 2 0.002 P2.5 retina GAGCCAATGT GGGCTCCAGC (2) 7.1 0.0071 P4.5 retina AAAAAAATGC CAGCTTTGGT GAGCCAATGT TGGTTGATGG 15.8 0.0158 P6.5 retina AAAAAAATGC GAGCCAATGT 6.7 0.0067 P10.5 crx+ retina CAGCTTTGGT GAGCCAATGT 11.5 0.0115 Adult retinal CAGCTTTGGT GAGCCAATGT TGGTTGATGG 9.4 0.0094 ONL AAAAAAATGC TGGTTGATGG 3.8 0.0038