| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2) CTTACCAAAA TATGCACACA (2)
| 13 | 0.013 |
| P8 GC+1d culture | ATGGCCTATG
| 2.3 | 0.0023 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CTTACCAAAA
| 1.2 | 0.0012 |
| 3T3 fibroblasts | ATGGCTATGG (2)
| 3.5 | 0.0035 |
| E15 cortex | TATGCACACA (2)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | ATGGCTATGG (2) CACAGACCTT (3)
| 9 | 0.009 |
| Hypothalamus | CTTACCAAAA
| 3.6 | 0.0036 |
| E12.5 retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2)
| 9.4 | 0.0094 |
| E14.5 retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2)
| 9.1 | 0.0091 |
| E16.5 retina | ATGGCCTATG CACAGACCTT (3) TATGCACACA (2)
| 9 | 0.009 |
| E18.5 retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2) TATGCACACA (2)
| 7.2 | 0.0072 |
| P0.5 retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2) TATGCACACA (2) TGGGTGAGGG (2)
| 15.8 | 0.0158 |
| P2.5 retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2) TGGGTGAGGG (2)
| 7.1 | 0.0071 |
| P4.5 retina | ATGGCTATGG (2) CACAGACCTT (3)
| 4 | 0.004 |
| P6.5 retina | ATGGCCTATG
| 5 | 0.005 |
| P10.5 crx- retina | ATGGCCTATG ATGGCTATGG (2) TATGCACACA (2)
| 7.5 | 0.0075 |
| P10.5 crx+ retina | ATGGCTATGG (2) TATGCACACA (2)
| 5.7 | 0.0057 |
| Adult retinal | ATGGCTATGG (2) TGGGTGAGGG (2)
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | TATGCACACA (2)
| 3.8 | 0.0038 |