Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.38802	D11Moh35	DNA segment, Chr 11, KL Mohlke 35	11	11 55.8 cM	268470
Gene Ontology	ligase activity
Human Homolog	FLJ13855[hypothetical protein FLJ13855]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 125 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GCACAACTTG (2) GCAGGGGCAA (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGCAGTCAGG TCCGGCATAG 243 0.243 Cb medulloblastoma GCACAACTTG (2) GCAGGGTGCA GCCAGGGCCA (2) TAGCAAAAAA TCCGGCATAG 603.4 0.6034 P8 GC+1d culture GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GTGATGCACA (3) GTGGCTGGGT TAGCAAAAAA TAGCCAAAAC TCCGGCATAG 280.7 0.2807 P8 GC+SHH+1d culture GCACAACTTG (2) GCAGGGGCAA (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGCAGTCAGG TAGCAAAAAA TAGCCAAAAA (2) TCCGGCATAG 289.2 0.2892 3T3 fibroblasts GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGCGTCAGGA (2) TCCGGCATAG 84.1 0.0841 E15 cortex GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GTGGCTGGGT TCCGGCATAG 237.3 0.2373 P1 cortex GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) TCCGGCATAG 113.6 0.1136 Hypothalamus GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) 239 0.239 E12.5 retina GCACAACTTG (2) GCAGGGCCAA GGAATCCTTG (3) TAGCCAAAAA (2) TAGCCAAAAC 107 0.107 E14.5 retina GCACAACTTG (2) GCAGGGCCAA GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) TAGCAAAAAA TAGCCAAAAC TCCGGCATAG TTGCTCAGGT (2) 162.1 0.1621 E16.5 retina GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GTCCCGGCAT (2) TCCGGCATAG 175.6 0.1756 E18.5 retina GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) TAGCAAAAAA TCCGGCATAG TTGCTCAGGT (2) 263.6 0.2636 P0.5 retina GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGGCAGAGCA (2) GTGGCTGGGT TCCGGCATAG 245.4 0.2454 P2.5 retina GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGCAGTCAGG GGCGTCAGGA (2) GTCCCGGCAT (2) GTGATGCACA (3) GTGGCTGGGT TAGCAAAAAA TCCGGCATAG 202.6 0.2026 P4.5 retina GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) TCCGGCATAG 204.2 0.2042 P6.5 retina ACACTTAAGC (3) GCACAACTTG (2) GCAGGGGCAA (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) TAGCCAAAAA (2) TCCGGCATAG 158.5 0.1585 P10.5 crx- retina ACACTTAAGC (3) GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GTGGCTGGGT TAGCAAAAAA TCCGGCATAG 226.8 0.2268 P10.5 crx+ retina GCACAACTTG (2) GCAGGGCCAA GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GTGATGCACA (3) GTGGCTGGGT TAGCCAAAAA (2) TCCGGCATAG 317.1 0.3171 Adult retinal ACACTTAAGC (3) GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGCAGTCAGG GTGGCTGGGT TAGCAAAAAA TCCGGCATAG 115 0.115 ONL GCACAACTTG (2) GCCAGGGCCA (2) GGAATCCTTG (3) GGGCAGAGCA (2) GTCCCGGCAT (2) GTGGCTGGGT TCCGGCATAG TTGCTCAGGT (2) 57.3 0.0573