Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.400 Cox6bcytochrome c oxidase, subunit VIb 7  7 10.0 cM  110323 
 Gene Ontology cytochrome-c oxidase activity | electron transport | mitochondrion | mitochondrion | oxidoreductase activity | respiratory chain complex IV (sensu Eukarya)
 Human Homolog COX6B1[cytochrome c oxidase subunit Vib polypeptide 1 (ubiquitous)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 108 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGCAACTAC (2)
ATGCAACTAT
ATGCGACTAC
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
83.20.0832
Cb medulloblastomaACACGGGACA (3)
ATGCAACTAC (2)
ATTCAGGGTC
GAGTTCAGCT (2)
1710.171
P8 GC+1d cultureACGCAACTAC
ATGCAACTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
120.80.1208
P8 GC+SHH+1d cultureACGCAACTAC
ATGCAACTAC (2)
ATTCAGGGTC
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
115.90.1159
3T3 fibroblastsATGCAACTAC (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
66.50.0665
E15 cortexATGCAACTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGTCTCAGCC (2)
49.30.0493
P1 cortexATGCAACTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
TAAACAAGCA (2)
72.70.0727
HypothalamusACACGGGACA (3)
ATGCAAACTA
ATGCAACTAC (2)
ATGCAACTAT
ATTCAGGGTC
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
247.90.2479
E12.5 retinaATGCAACTAC (2)
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
105.10.1051
E14.5 retinaACACGGGACA (3)
ACGCAACTAC
ATGCAACTAC (2)
ATGCAACTAT
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
167.50.1675
E16.5 retinaACACGGGACA (3)
ATGCAACTAC (2)
ATGCACCTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
190.10.1901
E18.5 retinaATGCAACTAC (2)
ATGCACCTAC (2)
ATTCAGGGTC
GAGTTCAGCT (2)
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
183.60.1836
P0.5 retinaATGCAACTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
74.70.0747
P2.5 retinaATGCAACTAC (2)
ATTCAGGGTC
GCCACTTACC
810.081
P4.5 retinaACACGGGACA (3)
ATGCAACTAC (2)
ATGCACCTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
101.20.1012
P6.5 retinaATGCAAACTA
ATGCAACTAC (2)
GGCTATGTGC
TAAACAAGCA (2)
111.70.1117
P10.5 crx- retinaATGCAACTAC (2)
ATTCAGGGTC
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
146.90.1469
P10.5 crx+ retinaATGCAACTAC (2)
GAGTTCAGCT (2)
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
980.098
Adult retinalATGCAACTAC (2)
GCCACTTACC
GGCCTCAGCC (4)
GGCTATGTGC
GGTCTCAGCC (2)
TAAACAAGCA (2)
74.20.0742
ONLATGCAAACTA
ATGCAACTAC (2)
GCCACTTACC
TAAACAAGCA (2)
460.046