| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG GAGGAGATCC (2) TCTTTTGTGT (3) TGCAATTCAA (2)
| 9.7 | 0.0097 |
| Cb medulloblastoma | CCTTTAATTC (3) GAGGAGATCC (2)
| 6.9 | 0.0069 |
| P8 GC+1d culture | TCTTTTGTGT (3)
| 2.3 | 0.0023 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CCTTTAATTC (3) TCTTTTGTGT (3) TGCAATTCAA (2)
| 9.4 | 0.0094 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG
| 10.5 | 0.0105 |
| E15 cortex | TGCAATTCAA (2)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | CCTTTAATTC (3)
| 13.6 | 0.0136 |
| Hypothalamus | GGACAGAACA TCTTTTGTGT (3)
| 3.6 | 0.0036 |
| E12.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 13.2 | 0.0132 |
| E14.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG
| 10.9 | 0.0109 |
| E16.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 7.2 | 0.0072 |
| E18.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| P0.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 9.9 | 0.0099 |
| P2.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAGATCC (2)
| 3.6 | 0.0036 |
| P4.5 retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 13.9 | 0.0139 |
| P6.5 retina | CCTTTAATTC (3) TCTTTTGTGT (3)
| 21.7 | 0.0217 |
| P10.5 crx- retina | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 9.4 | 0.0094 |
| P10.5 crx+ retina | GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 21.1 | 0.0211 |
| Adult retinal | CCTTTAATTC (3) GGACAGAACA TCTTTTGTGT (3) TGCAATTCAA (2)
| 20.5 | 0.0205 |
| ONL | CCTTTAATTC (3) GAGGAAGGGG TCTTTTGTGT (3)
| 15.3 | 0.0153 |