Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4871 Timp3tissue inhibitor of metalloproteinase 3 10  10 C1-D1 (10 47.0 cM)  21859 
 Mm.4871 B930095M22RikRIKEN cDNA B930095M22 gene 10    320124 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 66 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTGGTTACT (2)
CACACACAGG (5)
CCATTTTTTT (3)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
19.50.0195
Cb medulloblastomaCACACACAGG (5)
GGAATAAAAG (3)
GGAGGCAGGA
TGTAGGCTGT (2)
9.20.0092
P8 GC+1d cultureATTAAAGGAG
GCAGAATATC (2)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
TTGTGCTTCT (2)
18.20.0182
P8 GC+SHH+1d cultureATTGGTTACT (2)
CACACACAGG (5)
GCAGAATATC (2)
TGTACAGTTC
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
TTGTGCTTCT (2)
12.80.0128
3T3 fibroblastsTGTAGGCTGT (2)
TTGTGCTTCT (2)
10.50.0105
HypothalamusGCAGAATATC (2)
GGAATAAAAG (3)
GGAGGCAGGA
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
27.10.0271
E12.5 retinaATTAAAGGAG
GATAAAGGAA (2)
GCAGAATATC (2)
GGAGGCAGGA
TTATTTATGA (2)
13.30.0133
E14.5 retinaATTTTATATT (2)
CACACACAGG (5)
5.40.0054
E16.5 retinaATTAAAGGAG
ATTTTATATT (2)
CACACACAGG (5)
GATAAAGGAA (2)
GCAGAATATC (2)
TGTACAGTTC
14.40.0144
E18.5 retinaATTTTATATT (2)
CACACACAGG (5)
CCATTTTTTT (3)
5.40.0054
P0.5 retinaGATAAAGGAA (2)
GGAATAAAAG (3)
TTATTTATGA (2)
9.80.0098
P2.5 retinaATTAAAGGAG
ATTTTATATT (2)
GATAAAGGAA (2)
8.80.0088
P4.5 retinaATTTTATATT (2)
CCATTTTTTT (3)
GATAAAGGAA (2)
TGTAGGCTGT (2)
13.90.0139
P6.5 retinaATTAAAGGAG
ATTTTATATT (2)
GATAAAGGAA (2)
13.40.0134
P10.5 crx- retinaTGTAGGCTGT (2)
1.90.0019
P10.5 crx+ retinaATTTTATATT (2)
TGTAGGCTGT (2)
3.80.0038
Adult retinalCCATTTTTTT (3)
GATAAAGGAA (2)
TGTACAGTTC
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
9.50.0095
ONLATTTTATATT (2)
1.90.0019