Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.51049	1110021E09Rik	RIKEN cDNA 1110021E09 gene	3		66921
Human Homolog	FLJ10330[hypothetical protein FLJ10330]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) 16.3 0.0163 Cb medulloblastoma AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT GCTGTGCTTT (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 20.7 0.0207 P8 GC+1d culture AGTGTGGAAT (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 15.9 0.0159 P8 GC+SHH+1d culture AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT GAAAGAAGCT (2) GCTGTGCTTT (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 25.9 0.0259 E15 cortex TCACTTTTAA (2) 4.9 0.0049 P1 cortex GTCTCATTAT TTGGTTAAAT (2) 9 0.009 Hypothalamus AGTGTGGAAT (2) GTATGCCCTC (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 14.4 0.0144 E12.5 retina AGTGTGGAAT (2) GAAAGAAGCT (2) GCTGTGCTTT (2) TCACTTTTAA (2) TTGGTTAAAT (2) 18.9 0.0189 E14.5 retina AGTGTGGAAT (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 12.7 0.0127 E16.5 retina AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT GAAAGAAGCT (2) GTATGCCCTC (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) 21.6 0.0216 E18.5 retina AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT GAAAGAAGCT (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 29.1 0.0291 P0.5 retina AGTGTGGAAT (2) TCACTTTTAA (2) 9.8 0.0098 P2.5 retina AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT GAAAGAAGCT (2) GTCTCATTAT TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 14.2 0.0142 P4.5 retina AGTGTGGAAT (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) 11.9 0.0119 P6.5 retina AGTGTGGAAT (2) GTCTCATTAT TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) 15 0.015 P10.5 crx- retina AGTGTGGAAT (2) ATGGTTTTCT TTGGTTAAAT (2) 5.7 0.0057 P10.5 crx+ retina AGTGTGGAAT (2) TCTCAAAAAA (3) 11.5 0.0115 Adult retinal AGTGTGGAAT (2) GTATGCCCTC (2) TCACTTTTAA (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 16.8 0.0168 ONL AGTGTGGAAT (2) GTATGCCCTC (2) TCTCAAAAAA (3) TTGGTTAAAT (2) 13.4 0.0134