Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.5110 2610312E17RikRIKEN cDNA 2610312E17 gene 3    70465 
 Human Homolog MEP50[MEP50 protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 125 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATAAAAAAG (2)
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
GTTTTCCCCT (2)
TCTCTAGCTG (3)
TGTGGAAGAA
TTGCCCTGCT
22.70.0227
Cb medulloblastomaAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GCTTCAAAAA
GTTTTCCCCT (2)
TGTGGAAGAA
TTGCCCTGCT
36.80.0368
P8 GC+1d cultureAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
GCTTCAAAAA
GTTTTCCCCT (2)
TCTCTAGCTG (3)
TCTGGGAATT
TTGCCCTGCT
250.025
P8 GC+SHH+1d cultureAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
GTTTTCCCCT (2)
TAGTCCAGGC
TCAATTTTCC
TCTCTAGCTG (3)
TGTGGAAGAA
31.50.0315
3T3 fibroblastsCCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
TCTCTAGCTG (3)
140.014
E15 cortexGATTGTTACA
GTTTTCCCCT (2)
TCTCTAGCTG (3)
TTGCCCTGCT
24.60.0246
P1 cortexCCTTTAATTC (3)
GATTGTTACA
GTTTTCCCCT (2)
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
40.70.0407
HypothalamusAATAAAAAAG (2)
GAGGTGGAAT (2)
GTTTTCCCCT (2)
TCAATTTTCC
TCTCTAGCTG (3)
21.70.0217
E12.5 retinaAATAAAAAAG (2)
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
TCTGGGAATT
11.40.0114
E14.5 retinaAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
19.90.0199
E16.5 retinaAATAAAAAAG (2)
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
TAGTCCAGGC
14.40.0144
E18.5 retinaCCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GCTTCAAAAA
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
16.30.0163
P0.5 retinaAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GATTGTTACA
TCAATTTTCC
TCTCTAGCTG (3)
23.60.0236
P2.5 retinaAATAAAAAAG (2)
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
TCTCTAGCTG (3)
TGTGGAAGAA
29.90.0299
P4.5 retinaAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
TGTGGAAGAA
25.90.0259
P6.5 retinaATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
TTGCCCTGCT
28.40.0284
P10.5 crx- retinaAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
GTTTTCCCCT (2)
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
TCTGGGAATT
TGTGGAAGAA
39.20.0392
P10.5 crx+ retinaAATAAAAAAG (2)
GAGGTGGAAT (2)
GATTGTTACA
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
TTGCCCTGCT
230.023
Adult retinalAATAAAAAAG (2)
ATGACATTGT
CCTTTAATTC (3)
TAGTCCAGGC
TCTCTAGCTG (3)
TGTGGAAGAA
20.50.0205
ONLAATAAAAAAG (2)
CCTTTAATTC (3)
GTATCTATGT
TCTCTAGCTG (3)
TTGCCCTGCT
15.20.0152