| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | GAGGTCCTAG
| 1.6 | 0.0016 |
| Cb medulloblastoma | AACTCTTACC GAGCCAGCTC GGTGGCACTG
| 9.2 | 0.0092 |
| P8 GC+1d culture | AACTCTTACC AAGGTCCAAG CCTTGCTCAG GAGCCAGCTC GAGGTCCTAG GAGTTTGGGG GGTGGGGGTT
| 15.8 | 0.0158 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AACTCTTACC AAGGTCCAAG CCTGGCTCAG GAGGTCCTAG GGTGGCACTG
| 8.2 | 0.0082 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTGCTCAG GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 10.5 | 0.0105 |
| E15 cortex | GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 14.8 | 0.0148 |
| P1 cortex | AACTCTTACC
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | GAGGTCCTAG GAGTTTGGGG GGTGGGGGTT
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | AAGGTCCAAG
| 1.9 | 0.0019 |
| E14.5 retina | GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 9.1 | 0.0091 |
| E16.5 retina | GGTGGGGGTT
| 3.6 | 0.0036 |
| P0.5 retina | CCTGGCTCAG GAGCCAGCTC GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 9.9 | 0.0099 |
| P2.5 retina | CCTTGCTCAG GAGGTCCTAG GGTGGCACTG
| 8.9 | 0.0089 |
| P4.5 retina | AAGGTCCAAG GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 8 | 0.008 |
| P6.5 retina | ATGACCTGAT GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 20 | 0.02 |
| P10.5 crx- retina | AACTCTTACC GAGCCAGCTC GAGGTCCTAG GGTGGGGGTT
| 11.3 | 0.0113 |
| P10.5 crx+ retina | GAGGTCCTAG GAGTTTGGGG
| 3.8 | 0.0038 |
| Adult retinal | ATGACCTGAT GAGGTCCTAG GGTGGCACTG GGTGGGGGTT
| 11.3 | 0.0113 |
| ONL | CCTGGCTCAG GGTGGCACTG
| 3.8 | 0.0038 |