Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.7087 AA536951expressed sequence AA536951 14    105431 
 Mm.7087 Rabep1rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 11  11 42.0 cM  54189 
 Gene Ontology apoptosis | endocytosis | endosome | growth factor activity | GTPase activator activity | protein transport | transport
 Human Homolog RABEP1[rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 63 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
GCGCAGCCGG (2)
GGGCAGAAGG
130.013
Cb medulloblastomaCCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
GCGCAGCCGG (2)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureCCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
5.70.0057
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGCAACTT (2)
CCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
15.20.0152
3T3 fibroblastsGCAAGCAAAA (3)
3.50.0035
E15 cortexAAGAGAGCAG
4.90.0049
P1 cortexAGCTCACTCC (2)
CCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
13.50.0135
HypothalamusAGCTCACTCC (2)
GAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
TTTGAAGAGA (3)
12.60.0126
E12.5 retinaGAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
TGCCCCCGGG
TTTGAAGAGA (3)
18.80.0188
E14.5 retinaCCCTTAAGAA (4)
GAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
GCGCAGCCGG (2)
TTTGAAGAGA (3)
19.90.0199
E16.5 retinaAAGAGAGCAG
CCCTTAAGAA (4)
GAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
TGCCCCCGGG
25.30.0253
E18.5 retinaGAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
GCGCAGCCGG (2)
TGCCCCCGGG
38.10.0381
P0.5 retinaAGCTCACTCC (2)
CCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
11.80.0118
P2.5 retinaAAAGCAACTT (2)
AAGAGAGCAG
CCCTTAAGAA (4)
GAGAGAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
15.90.0159
P4.5 retinaCCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
9.90.0099
P6.5 retinaAAAGCAACTT (2)
CCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
200.02
P10.5 crx- retinaGCAAGCAAAA (3)
TGCCCCCGGG
3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCCCTTAAGAA (4)
GCAAGCAAAA (3)
GCGCAGCCGG (2)
GGGCAGAAGG
17.30.0173
Adult retinalCCCTTAAGAA (4)
GAGAAGGAAA
GCAAGCAAAA (3)
9.30.0093
ONLAGCTCACTCC (2)
GAGAAGGAAA
7.60.0076