| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library | 
| P8 Cb GC | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 GGCACAAGGT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 31 | 0.031 | 
| Cb medulloblastoma | CTTATTAAAA (2) TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 9.2 | 0.0092 | 
| P8 GC+1d culture | AAAATATTGA (3) CCTTTAATCT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 12.4 | 0.0124 | 
| P8 GC+SHH+1d culture | AAAATATTGA (3) CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 24.7 | 0.0247 | 
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATCT (2) 
 | 10.5 | 0.0105 | 
| P1 cortex | AAAATATTGA (3) CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 
 | 22.6 | 0.0226 | 
| Hypothalamus | AAAATATTGA (3) CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 
 | 14.4 | 0.0144 | 
| E12.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 33.9 | 0.0339 | 
| E14.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 
 | 45.6 | 0.0456 | 
| E16.5 retina | AAAATATTGA (3) TGTATGTCTG (3)
 
 | 19.9 | 0.0199 | 
| E18.5 retina | AAAATATTGA (3) CTTATTAAAA (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 23.7 | 0.0237 | 
| P0.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 GGCACAAGGT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 31.4 | 0.0314 | 
| P2.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CTTATTAAAA (2)
 GGCACAAGGT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 
 | 37 | 0.037 | 
| P4.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CGCCACCATT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 39.6 | 0.0396 | 
| P6.5 retina | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CGCCACCATT (2)
 GGCACAAGGT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 
 | 31.8 | 0.0318 | 
| P10.5 crx- retina | AAAATATTGA (3) TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 11.2 | 0.0112 | 
| P10.5 crx+ retina | GGCACAAGGT (2) TGTATGTCTG (3)
 
 | 15.4 | 0.0154 | 
| Adult retinal | CCTTTAATCT (2) GGCACAAGGT (2)
 TGTATGTCTG (3)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 16.8 | 0.0168 | 
| ONL | AAAATATTGA (3) ACGAGCGTAT (2)
 CCTTTAATCT (2)
 CGCCACCATT (2)
 GGCACAAGGT (2)
 TTGAAAAAAA (9)
 
 | 24.8 | 0.0248 |