Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.9002 Ube3aubiquitin protein ligase E3A 7  7 28.65 cM  22215 
 Mm.9002 5830462N02RikRIKEN cDNA 5830462N02 gene 7    76097 
 Mm.9002 A130086L21RikRIKEN cDNA A130086L21 gene 7    320572 
 Mm.9002 C230091D08RikRIKEN cDNA C230091D08 gene 7    330544 
 Mm.9002 9330162G02RikRIKEN cDNA 9330162G02 gene 7    319534 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 128 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CCTTTAATTT (5)
CTGTAAACAA (5)
CTGTTTTAAA (6)
26.10.0261
Cb medulloblastomaAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
CTGTTTTAAA (6)
TGGCAAATGC (6)
TTCATTTTTA
20.80.0208
P8 GC+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
GTTGTATACA (5)
TTAATGTGAA
14.70.0147
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
CTGTAACCAA (5)
TGGCAAATGC (6)
TTCATTTTTA
18.70.0187
3T3 fibroblastsACCATTAACT (5)
CCTTTAATCT (2)
GGGAATTGGG
17.50.0175
E15 cortexACAGTGGGGC (5)
ATTCATTTGA
TGGCAAATGC (6)
14.70.0147
P1 cortexACCATTAACT (5)
CCTTTAATCT (2)
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
180.018
HypothalamusACAGTGGGGC (5)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
CTGTTTTAAA (6)
GGGAATTGGG
TTAATGTGAA
36.10.0361
E12.5 retinaACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
GTTGTATACA (5)
15.10.0151
E14.5 retinaAATTTATTTT (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
CTGTTTTAAA (6)
GGGAATTGGG
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
36.40.0364
E16.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CTGTAAACAA (5)
GGGAATTGGG
TTAATGTGAA
30.80.0308
E18.5 retinaAAACTTTCAA
AAGAGAAAAA (6)
AATTTATTTT (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CTGTAAACAA (5)
CTGTTTTAAA (6)
GGGAATTGGG
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
TTTTCAATGG (2)
28.90.0289
P0.5 retinaACAGTGGGGC (5)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
TTAATGTGAA
TTTTCAATGG (2)
17.80.0178
P2.5 retinaATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
GGGAATTGGG
TTAATGTGAA
TTTTCAATGG (2)
19.40.0194
P4.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
ACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
GGGAATTGGG
TTAATGTGAA
TTTTCAATGG (2)
29.80.0298
P6.5 retinaAAACTTTCAA
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTTTTAAA (6)
GGGAATTGGG
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
TTCATTTTTA
30.20.0302
P10.5 crx- retinaAAGAGAAAAA (6)
AATTTATTTT (6)
ACCATTAACT (5)
CCTTTAATTT (5)
GGGAATTGGG
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
TTTTCAATGG (2)
39.30.0393
P10.5 crx+ retinaACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CTGTAAACAA (5)
GGGAATTGGG
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
15.20.0152
Adult retinalACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
CTGTAAACAA (5)
GTTGTATACA (5)
TGGCAAATGC (6)
TTAATGTGAA
22.40.0224
ONLACCATTAACT (5)
ATTCATTTGA
CCTTTAATCT (2)
TTAATGTGAA
TTCATTTTTA
22.90.0229