Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.9593 Sh2d3cSH2 domain containing 3C 2    27387 
 Mm.9593 6330409D20RikRIKEN cDNA 6330409D20 gene 2    70730 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 38 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTCTCTTTCA (2)
TTTTCTTTCA (3)
9.80.0098
Cb medulloblastomaTACAGCCACA (2)
6.90.0069
P8 GC+1d cultureCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
TCCTCTGCAC (2)
TTTCAAGCTT
TTTTCTTTCA (3)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
TTTCAAGCTT
TTTTCTTTCA (3)
14.10.0141
E15 cortexTACAGCCACA (2)
4.90.0049
P1 cortexCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
90.009
HypothalamusCTCTCTTTCA (2)
5.40.0054
E12.5 retinaAAGAGCTGGA (3)
TACAGCCACA (2)
TCCTCTGCAC (2)
7.60.0076
E14.5 retinaCTCTCTTTCA (2)
3.60.0036
E16.5 retinaCTCTCTTTCA (2)
3.60.0036
P0.5 retinaAAGAGCTGGA (3)
CTCTCTTTCA (2)
TTTCAAGCTT
11.90.0119
P2.5 retinaAAGAGCTGGA (3)
CTCTCTTTCA (2)
5.30.0053
P4.5 retinaTACAGCCACA (2)
20.002
P6.5 retinaCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
TTTCAAGCTT
5.10.0051
P10.5 crx- retinaCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
TTTCAAGCTT
9.30.0093
P10.5 crx+ retinaTACAGCCACA (2)
3.80.0038
Adult retinalTACAGCCACA (2)
TTTCAAGCTT
5.60.0056
ONLCTCTCTTTCA (2)
TACAGCCACA (2)
3.80.0038