Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.196110 Hbahemoglobin alpha chain complex 11  11 16.0 cM  15121 
 Mm.196110 Hba-a1hemoglobin alpha, adult chain 1 11  11 16.0 cM  15122 
 Gene Ontology hemoglobin complex | mitochondrion | oxygen transport | oxygen transporter activity | transport
 Human Homolog HBA1[hemoglobin, alpha 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 131 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCCTTCTTCT (3)
CCGTTCTTCT (4)
CCTCTCTGGA (2)
GCACTTCTTC (4)
GCCACAAGCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTGCTGAATA (2)
TCCTTCTTCT (2)
930.093
Cb medulloblastomaCCCACAAGCT (2)
CCCTTCTTCT (3)
CCGTTCTTCT (4)
CCTCTCTGGA (2)
GCCAGAAGGC (2)
GCTTCTTCTG (4)
117.80.1178
P8 GC+1d cultureAAAGTAATCA (2)
AATAAATTAG (2)
CACTGAGGGG (2)
CCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTTCCTT (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCACTTCTTC (4)
GCTTCTTCTG (4)
TCACATAGGA (4)
40.90.0409
P8 GC+SHH+1d cultureCAAACACCTC (2)
CCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTCTTGG (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
31.70.0317
3T3 fibroblastsCACTGAGGGG (2)
CCCTTAATCT (3)
GCTTCTTCTG (4)
24.50.0245
E15 cortexCCCACAAGCT (2)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTCTTTC (2)
CCCTTTCCTT (2)
CCTCTCTGGA (2)
GCTTCTTCTG (4)
TCCTTCTTCT (2)
202.60.2026
P1 cortexCCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTCTTGG (2)
CCCTTTCCTT (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
270.027
HypothalamusAAAGTAATCA (2)
CCCACAAGCT (2)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTTTTTT (4)
CCTCTCTGGA (2)
GCCAGAAGGC (2)
GCCTCTCTGG (3)
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTTCTG (4)
GTGCTCTCTG (3)
GTGCTGAATA (2)
61.30.0613
E12.5 retinaCCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCGTTCTTCT (4)
CCTGCGTCTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
67.60.0676
E14.5 retinaAATAAATTAG (2)
CCCTTCTTCT (3)
GCACTTCTTC (4)
GCCAGAAGGC (2)
GCCTCTCTGG (3)
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTTCTG (4)
GTGCTGAATA (2)
GTTTCTTCCT (2)
TTTAATAAAA (8)
67.20.0672
E16.5 retinaAAAGTAATCA (2)
CCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTTCCTT (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCACTTCTTC (4)
GCCAGAAGGC (2)
GCCTTCTTCT (2)
GCTTCTTCTG (4)
GTGCTGAATA (2)
TCACATAGGA (4)
TCCTTCTTCT (2)
52.40.0524
E18.5 retinaCCCTTCTTCT (3)
CCGTTCTTCT (4)
GCACTTCTTC (4)
GCTTCTTCTG (4)
200.02
P0.5 retinaCCCTTCTTCT (3)
CCCTTCTTGG (2)
CCTCTCTGGA (2)
GCCACAAGCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
21.70.0217
P2.5 retinaCCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
GCCACAAGCT (4)
GCCAGAAGGC (2)
GCCTCTCTGG (3)
GCTTCTTCTG (4)
40.60.0406
P4.5 retinaAAAGTAATCA (2)
CACTGAGGGG (2)
CCCTTAATCT (3)
CCCTTCTTCT (3)
CCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
TTTAATAAAA (8)
33.80.0338
P6.5 retinaCCCTTCTTCT (3)
CCCTTTTTTT (4)
CCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTTTCTTCCT (2)
28.40.0284
P10.5 crx- retinaCCGTTCTTCT (4)
GCCTCTCTGG (3)
GCTTCTTCTG (4)
TCACATAGGA (4)
9.40.0094
P10.5 crx+ retinaCAAACACCTC (2)
CCCTTCTTCT (3)
CCCTTTCCTT (2)
CCGTTCTTCT (4)
CCTGCGTCTC (2)
GCTTCTTCTG (4)
TTTAATAAAA (8)
47.90.0479
Adult retinalCCCTTCTTCT (3)
CCCTTCTTTC (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
TCCTTCTTCT (2)
TTTAATAAAA (8)
18.80.0188
ONLCCGTTCTTCT (4)
GCTTCTTCTG (4)
GTGCTGAATA (2)
15.30.0153