Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.22109	2610204L23Rik	RIKEN cDNA 2610204L23 gene	11	11 E1	67163
Mm.22109	D13Mgi22	DNA Segment, Chr 13, Mouse Genome Informatics 22	13		97906
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 14 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAATTTCTAG (2) GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TACACAGTAG (5) TTTTTTAACA (2) 11.3 0.0113 Cb medulloblastoma GCTTTGTGTA (4) TTTTTTAACA (2) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture ATACAATCTG (2) CAGGTGATAC (2) GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) GGAAGAAGAC (2) TACACAGTAG (5) TTTTTTAACA (2) 13.6 0.0136 P8 GC+SHH+1d culture GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TAGAGCTGGT (2) TTTTTTAACA (2) 9.4 0.0094 3T3 fibroblasts GCTTTGTGTA (4) 3.5 0.0035 E15 cortex GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) 14.8 0.0148 P1 cortex GCTTTGTGTA (4) 4.5 0.0045 Hypothalamus AAATTTCTAG (2) ATACAATCTG (2) TACACAGTAG (5) TAGAGCTGGT (2) 9 0.009 E12.5 retina AAATTTCTAG (2) GAGGAGCTGA (3) TTTTTTAACA (2) 7.6 0.0076 E14.5 retina GAAGATTCTG (2) GCTTTGTGTA (4) GGAAGAAGAC (2) TACACAGTAG (5) TAGAGCTGGT (2) 12.6 0.0126 E16.5 retina TACACAGTAG (5) 1.8 0.0018 E18.5 retina AAATTTCTAG (2) ATACAATCTG (2) GAGGAGCTGA (3) TTTTTTAACA (2) 7.2 0.0072 P0.5 retina GCTTTGTGTA (4) TACACAGTAG (5) TAGAGCTGGT (2) TTTTTTAACA (2) 11.8 0.0118 P2.5 retina GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TACACAGTAG (5) TAGAGCTGGT (2) TTTTTTAACA (2) 12.4 0.0124 P4.5 retina AGGCGGAACG (2) GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TTTTTTAACA (2) 13.9 0.0139 P6.5 retina AGGCGGAACG (2) GCTTTGTGTA (4) TACACAGTAG (5) TTTTTTAACA (2) 11.6 0.0116 P10.5 crx- retina AAATTTCTAG (2) AGGCGGAACG (2) CAGGTGATAC (2) GAAGATTCTG (2) GCTTTGTGTA (4) TAGAGCTGGT (2) 26.2 0.0262 P10.5 crx+ retina AAATTTCTAG (2) AGGCGGAACG (2) GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TACACAGTAG (5) TTTTTTAACA (2) 30.7 0.0307 Adult retinal AGGCGGAACG (2) GAGGAGCTGA (3) TACACAGTAG (5) TTTTTTAACA (2) 15 0.015 ONL AGGCGGAACG (2) GAGGAGCTGA (3) GCTTTGTGTA (4) TTTTTTAACA (2) 9.5 0.0095