| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 34.3 | 0.0343 |
| Cb medulloblastoma | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 13.8 | 0.0138 |
| P8 GC+1d culture | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA GGGTGCCAGG GTGCGTGGGT
| 22.7 | 0.0227 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 19.9 | 0.0199 |
| 3T3 fibroblasts | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA
| 10.5 | 0.0105 |
| E15 cortex | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 34.6 | 0.0346 |
| P1 cortex | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT TCCAGGATAA (3)
| 18.1 | 0.0181 |
| Hypothalamus | CTTAAGGATC (3) GGGTGCCAGG TCCAGGATAA (3)
| 18.1 | 0.0181 |
| E12.5 retina | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 43.1 | 0.0431 |
| E14.5 retina | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA GTGCGTGGGT TCCAGGATAA (3)
| 32.7 | 0.0327 |
| E16.5 retina | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA GTGCGTGGGT
| 36.2 | 0.0362 |
| E18.5 retina | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA GTGCGTGGGT
| 40 | 0.04 |
| P0.5 retina | CTTAAGGATC (3) GGGTGCCAGG GTGCGTGGGT
| 37.3 | 0.0373 |
| P2.5 retina | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 21.1 | 0.0211 |
| P4.5 retina | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 17.8 | 0.0178 |
| P6.5 retina | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT TCCAGGATAA (3)
| 20.1 | 0.0201 |
| P10.5 crx- retina | CTTAAGGATC (3) GTGCGTGGGT
| 9.3 | 0.0093 |
| P10.5 crx+ retina | CTTAAGGATC (3) GGGTGCCAGG GTGCGTGGGT
| 19.2 | 0.0192 |
| Adult retinal | CTTAAGGATC (3) GAGAGCATTA GTGCGTGGGT
| 16.7 | 0.0167 |
| ONL | CTTAAGGATC (3)
| 3.8 | 0.0038 |