| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AACGTGAGGT CAGCTATCAG CTCCGTTCCT GGCTGGAAGA (4)
| 13 | 0.013 |
| Cb medulloblastoma | AACGTGAGGT CAGCTATCAG
| 6.9 | 0.0069 |
| P8 GC+1d culture | AACGTGAGGT AGTGCTTGTA CAGCTATCAG GGCTGGAAGA (4)
| 6.8 | 0.0068 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AACGTGAGGT CAGCTATCAG TCAGGACAAA
| 8.2 | 0.0082 |
| 3T3 fibroblasts | AACGTGAGGT CTCCGTTCCT
| 7 | 0.007 |
| E15 cortex | AACGTGAGGT CTCCGTTCCT
| 14.8 | 0.0148 |
| P1 cortex | AACGTGAGGT
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | AACGTGAGGT TCAGGACAAA
| 5.4 | 0.0054 |
| E12.5 retina | AACGTGAGGT AGTGCTTGTA TCAGGACAAA
| 9.4 | 0.0094 |
| E14.5 retina | CTCCGTTCCT
| 1.8 | 0.0018 |
| E16.5 retina | AACGTGAGGT AGTGCTTGTA CAGCTATCAG
| 7.2 | 0.0072 |
| E18.5 retina | AACGTGAGGT GGCTGGAAGA (4)
| 3.6 | 0.0036 |
| P0.5 retina | AACGTGAGGT CAGCTATCAG TCAGGACAAA
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | AACGTGAGGT TCAGGACAAA
| 5.3 | 0.0053 |
| P4.5 retina | AACGTGAGGT AGTGCTTGTA
| 9.9 | 0.0099 |
| P6.5 retina | AACGTGAGGT CAGCTATCAG CTCCGTTCCT GGCTGGAAGA (4)
| 8.4 | 0.0084 |
| P10.5 crx- retina | AACGTGAGGT CAGCTATCAG
| 5.6 | 0.0056 |
| P10.5 crx+ retina | AACGTGAGGT TACCACTGCT
| 7.6 | 0.0076 |
| Adult retinal | AACGTGAGGT AGTGCTTGTA CTCCGTTCCT GGCTGGAAGA (4) TACCACTGCT
| 13.1 | 0.0131 |
| ONL | AACGTGAGGT
| 1.9 | 0.0019 |