| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 13.1 | 0.0131 |
| Cb medulloblastoma | GGCCTTGGGC TGAAGGGGGG
| 4.6 | 0.0046 |
| P8 GC+1d culture | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT GGCCTTGGGC TGAAGGGGGG TGGCTGGTGC
| 36.4 | 0.0364 |
| P8 GC+SHH+1d culture | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT GGCCTTGGGC
| 26.9 | 0.0269 |
| E15 cortex | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 24.6 | 0.0246 |
| P1 cortex | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT GGCCTTGGGC
| 49.9 | 0.0499 |
| Hypothalamus | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 7.2 | 0.0072 |
| E12.5 retina | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 5.7 | 0.0057 |
| E14.5 retina | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 16.3 | 0.0163 |
| E16.5 retina | ACATTTACAG (2) CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT GGCCTTGGGC
| 29 | 0.029 |
| E18.5 retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 16.3 | 0.0163 |
| P0.5 retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT TGAAGGGGGG
| 25.5 | 0.0255 |
| P2.5 retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 17.6 | 0.0176 |
| P4.5 retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 4 | 0.004 |
| P6.5 retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT TGGCTGGTGC
| 25.1 | 0.0251 |
| P10.5 crx- retina | GCCCTATGCT GGCCTTGGGC
| 18.6 | 0.0186 |
| P10.5 crx+ retina | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 11.5 | 0.0115 |
| Adult retinal | CAGAGCTCCC (2) GCCCTATGCT
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | ACATTAACAG
| 19.2 | 0.0192 |