Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.277599	Stub1	STIP1 homology and U-Box containing protein 1	17	17 11.6 cM	56424
Mm.277599	2310040B03Rik	RIKEN cDNA 2310040B03 gene	17		69636
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 71 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 11.3 0.0113 Cb medulloblastoma AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) TACCGGTTGT (3) 16.1 0.0161 P8 GC+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) TCCTGCCTGG (4) 17 0.017 P8 GC+SHH+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) TACCGGTTGT (3) 14.1 0.0141 E15 cortex AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) TCCTGCCTGG (4) 19.7 0.0197 P1 cortex TACCGGTTGT (3) 4.5 0.0045 Hypothalamus AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) TACCGGTTGT (3) 23.5 0.0235 E12.5 retina AGCCTCCCTT (3) GTTCTGGTGG (3) GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) 31.9 0.0319 E14.5 retina ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) 7.2 0.0072 E16.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) TACCGGTTGT (3) 14.4 0.0144 E18.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) 16.4 0.0164 P0.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TCCTGCCTGG (4) 11.9 0.0119 P2.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 26.5 0.0265 P4.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) TACCGGTTGT (3) 19.9 0.0199 P6.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 21.7 0.0217 P10.5 crx- retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 18.6 0.0186 P10.5 crx+ retina CCACCACCGA (2) GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) 13.5 0.0135 Adult retinal AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 20.5 0.0205 ONL ACCCTCGTGG (3) CCACCACCGA (2) GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 11.4 0.0114