Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.290407	Nap1l1	nucleosome assembly protein 1-like 1	10	10 60.0 cM	53605
Mm.290407	D10Ertd284e	DNA segment, Chr 10, ERATO Doi 284, expressed	10	10 60.0 cM	52558
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 75 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 14.7 0.0147 Cb medulloblastoma AAGTTGCATT (4) GGATGCTGTC (4) TTTAGGCTAT (2) 9.2 0.0092 P8 GC+1d culture AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 18.2 0.0182 P8 GC+SHH+1d culture AAGTTGCATT (4) ACTCATTTAC (2) AGAGCTAAAA (2) ATGAACCTAT (3) GGATGCTGTC (4) TTGTTAGAGG (3) 30.4 0.0304 3T3 fibroblasts ATCTCGAGAG (3) TTGTTAGAGG (3) 49 0.049 E15 cortex ATCTCGAGAG (3) ATGAACCTAT (3) GGATGCTGTC (4) TTGTTAGAGG (3) 19.6 0.0196 P1 cortex ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 22.7 0.0227 Hypothalamus AAGTTGCATT (4) TTGTTAGAGG (3) 3.6 0.0036 E12.5 retina AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) ATCTCGAGAG (3) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 22.7 0.0227 E14.5 retina ACTCATTTAC (2) AGAGCTAAAA (2) 3.6 0.0036 E16.5 retina ATCTCGAGAG (3) TTCATTTATT (3) TTGTTAGAGG (3) 10.8 0.0108 E18.5 retina AAGTTGCATT (4) ACTCATTTAC (2) AGAGCTAAAA (2) ATGAACCTAT (3) TTCATTTATT (3) TTGTTAGAGG (3) 16.3 0.0163 P0.5 retina AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) ATCTCGAGAG (3) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) TTTAGGCTAT (2) 37.4 0.0374 P2.5 retina AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) ATGAACCTAT (3) TTCATTTATT (3) TTGTTAGAGG (3) 10.7 0.0107 P4.5 retina AAGTTGCATT (4) AGAGCTAAAA (2) TTCATTTATT (3) TTGTTAGAGG (3) 11.9 0.0119 P6.5 retina AAGTTGCATT (4) ACTCATTTAC (2) ATCTCGAGAG (3) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 21.7 0.0217 P10.5 crx- retina AAGTTGCATT (4) TTGTTAGAGG (3) 9.3 0.0093 P10.5 crx+ retina AAGTTGCATT (4) ATCTCGAGAG (3) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 11.5 0.0115 Adult retinal AAGTTGCATT (4) ATGAACCTAT (3) TTGTTAGAGG (3) 5.7 0.0057 ONL AAGTTGCATT (4) ATGAACCTAT (3) TTCATTTATT (3) 13.3 0.0133