Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.100117 4930528A17RikRIKEN cDNA 4930528A17 gene 4    67735 
 Mm.100117 5730406M06RikRIKEN cDNA 5730406M06 gene 4    66625 
 Human Homolog C6orf111[chromosome 6 open reading frame 111]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 11 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 72 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAGATCTA (3)
AGTTTAAGGG (2)
GATGCCACCA (3)
TTTACCAAAA (4)
6.40.0064
Cb medulloblastomaGATGCCACCA (3)
2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAGATCTA (3)
AGTTTAAGGG (2)
TGATGGATTG (3)
TTAATTTGTG (3)
TTTACCAAAA (4)
12.50.0125
P8 GC+SHH+1d cultureAGTTTAAGGG (2)
GGGCTGCTTT (2)
5.90.0059
3T3 fibroblastsAAAAGATCTA (3)
AGTTTAAGGG (2)
GATGCCACCA (3)
GGGCTGCTTT (2)
TGATGGATTG (3)
210.021
E15 cortexAGTTTAAGGG (2)
GGGCTGCTTT (2)
9.80.0098
P1 cortexAGTTTAAGGG (2)
GATGCCACCA (3)
GCTAGTGAAC (2)
GGGCTGCTTT (2)
TGATGGATTG (3)
TTAATTTGTG (3)
31.60.0316
HypothalamusTGATGGATTG (3)
TTTACCAAAA (4)
5.40.0054
E12.5 retinaAAAAGATCTA (3)
AGTTTAAGGG (2)
CAAAGAGAAA (2)
GATGCCACCA (3)
TTTACCAAAA (4)
13.30.0133
E14.5 retinaAAAAGATCTA (3)
GGAATTTTCA (2)
TTTACCAAAA (4)
12.70.0127
E16.5 retinaTTTACCAAAA (4)
1.80.0018
E18.5 retinaAGTTTAAGGG (2)
GGGCTGCTTT (2)
TTTACCAAAA (4)
10.90.0109
P0.5 retinaAGTTTAAGGG (2)
CAAAGAGAAA (2)
GATGCCACCA (3)
GGGCTGCTTT (2)
TTTACCAAAA (4)
21.70.0217
P2.5 retinaAGTTTAAGGG (2)
GGAATTTTCA (2)
TTTACCAAAA (4)
14.10.0141
P4.5 retinaAGTTTAAGGG (2)
GCTAGTGAAC (2)
GGGCTGCTTT (2)
TTTACCAAAA (4)
29.80.0298
P6.5 retinaAGTTTAAGGG (2)
CCTAACACCT (2)
GGGCTGCTTT (2)
TTTACCAAAA (4)
23.40.0234
P10.5 crx- retinaAAAAGATCTA (3)
AGTTTAAGGG (2)
CCTAACACCT (2)
GCTAGTGAAC (2)
TTTACCAAAA (4)
9.50.0095
P10.5 crx+ retinaAGTTTAAGGG (2)
CCTAACACCT (2)
GATGCCACCA (3)
TTTACCAAAA (4)
21.10.0211
Adult retinalAGTTTAAGGG (2)
CCTAACACCT (2)
GGGCTGCTTT (2)
TTAATTTGTG (3)
TTTACCAAAA (4)
13.10.0131
ONLAGTTTAAGGG (2)
CAAAGAGAAA (2)
GCTAGTGAAC (2)
11.40.0114