Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1022 D4Ucla1DNA segment, Chr 4, University of California at Los Angeles 1 4  4 78.3 cM  28148 
 Mm.1022 Cdc42cell division cycle 42 homolog (S. cerevisiae) 4  4 66.75 cM  12540 
 Gene Ontology actin filament organization | filopodium | GTP binding | GTPase activity | GTPase activity | protein binding | Rho protein signal transduction | small GTPase mediated signal transduction
 Human Homolog CDC42[cell division cycle 42 (GTP binding protein, 25kDa)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 245 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAAGAA
GGGATCAGTC (2)
GGGTGGGGGA (3)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TAGACAAGCC
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
1370.137
Cb medulloblastomaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
CCTTGGAATT
GAAAAAAAAA (2)
GGGTTGGGGA (2)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
337.40.3374
P8 GC+1d cultureAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
CCTTGGAATT
GAAAAAAAAA (2)
GAAGAAAAAA (3)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TAAGAAAATG (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
155.10.1551
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
CCTTGGAATT
CTTGTATTGA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAAGAAAAAA (3)
GGGATCAGTC (2)
GGGTGGGGGA (3)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
200.60.2006
3T3 fibroblastsATCAAGCAGA
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
38.50.0385
E15 cortexGAAAAAAAAA (2)
GGGATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
790.079
P1 cortexAAAGTGGGTG
AAGGTGGGTG (2)
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GGGTGGGGAG (2)
GGGTGGGGGA (3)
TAAAAAAAAA (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TTGGTTAAAA (2)
149.90.1499
HypothalamusAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ACTTTATTTA (2)
ATCAAGCAGA
GAAAAAAAAA (2)
GGGTGGGGGA (3)
GGGTTGGGGA (2)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TAGACAAGCC
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TGGGTAGGTG (2)
TTGGTTAAAA (2)
353.10.3531
E12.5 retinaAAAGTGGGTG
AAGGTGGGTG (2)
ATCAAGCAGA
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAGAAAAAA (3)
GGGATCAGTC (2)
GGGTGGGGGA (3)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
103.40.1034
E14.5 retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAAGAA
GAAGAAAAAA (3)
GGGTGGGGAG (2)
GGGTTGGGGA (2)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
127.30.1273
E16.5 retinaAAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
ACTTTATTTA (2)
ATCAAGCAGA
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GGGTTGGGGA (2)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TAAGAAAATG (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
88.50.0885
E18.5 retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
CCTGCAAAAG
CTTGTATTGA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GGGATCAGTC (2)
GGGTGGGGGA (3)
GGGTTGGGGA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
241.70.2417
P0.5 retinaAAAGTGGGTG
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
90.30.0903
P2.5 retinaAAAGTGGGTG
ATCAAGCAGA
ATTCTTTATA (3)
CCTGCAAAAG
GAAAAAAAAA (2)
GAAGAAAAAA (3)
GGGTGGGGAG (2)
GGGTTGGGGA (2)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
2060.206
P4.5 retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
CCTTGGAATT
GAAAAAAAAA (2)
GGGATCAGTC (2)
GGGTGGGGGA (3)
GGGTTGGGGA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
210.20.2102
P6.5 retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ACTTTATTTA (2)
ATCAAGCAGA
CCTTGGAATT
GAAAAAAAAA (2)
GAAGAAAAAA (3)
GGGTGGGGGA (3)
GGGTTGGGGA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
146.90.1469
P10.5 crx- retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ACTTTATTTA (2)
ATTCTTTATA (3)
CCTTGGAATT
GAAAAAAAAA (2)
GGGTGGGGGA (3)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
TGAGACAAGG (2)
TTGGTTAAAA (2)
85.60.0856
P10.5 crx+ retinaAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
AAGGTGGGTG (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAAGAA
GGGTGGGGGA (3)
GTCCAAGAAC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TATCTGCTTA (2)
TGAGACAAGG (2)
109.50.1095
Adult retinalAAAGTGGGTG
ATTCTTTATA (3)
CCTGCAAAAG
GAAAAAAAAA (2)
GGGTGGGGGA (3)
GGGTTGGGGA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TATCTGCTTA (2)
TCTCCTGATA (2)
57.70.0577
ONLAAAGTGGGTG
AAATGAAATA (3)
ATTCTTTATA (3)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAAGAA
GAAGAAAAAA (3)
GGGTTGGGGA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACATAAAAT (2)
TCTCCTGATA (2)
TTGGTTAAAA (2)
116.70.1167