Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.104368	Rpl32	ribosomal protein L32	6	6 50.5 cM	19951
Gene Ontology	cytosolic large ribosomal subunit (sensu Eukarya) | cytosolic large ribosomal subunit (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | protein biosynthesis | ribosome | RNA binding | structural constituent of ribosome | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPL32[ribosomal protein L32]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 228 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACCTTTTCTT CCGCTGCGTG CTGCCCAGCG CTTTATGTTT CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GGCCTTGCTG (2) TGTGATGTTT TTCTCCCCCC TTTAATGTTT (2) TTTTATGTCT (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 260.9 0.2609 Cb medulloblastoma ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCCCCCCCCC (3) CTGCCAGCGG CTTTATGTTT GATGCCCTCC TGTGATGTTT TTTTATGTTT (2) 71.6 0.0716 P8 GC+1d culture ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCCCCCCCCC (3) CCGCTGCGTG CTGCCCAGCG CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA GATGCCCTCC GCTGCCCTCG (3) GTGAACACTG TTTTATGGTT TTTTATGTTT (2) 231.6 0.2316 P8 GC+SHH+1d culture ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCCCCCCCCC (3) CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTGCCCAGCG CTGCCCCAGC CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA GATGCCCTCC GCTGCCCTCG (3) TGTGATGTTT TTTAAGGTTT TTTTATGGTT TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 233.3 0.2333 3T3 fibroblasts CCGCTGCGTG CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA GATGCCCTCC TGCTTGGTTT (2) TTTTATGTTT (2) 119.2 0.1192 E15 cortex CACACAAGCC CCCCCCCCCC (3) CCGCTGCGTG CTGCCCAGCG CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA TTTTATGTTT (2) 83.9 0.0839 P1 cortex ACCTTTTCTT CCGCTGCGTG GATGCCCTCC GCTGCCCTCG (3) TGCCTACAGG TTTTATGGTT TTTTATGTCT (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 145.2 0.1452 Hypothalamus ACCTTTTCTT ATGCCGTAAA CACACAAGCC CTGCCCAGCG GATGCCCTCC GCTGCCCCTC TAATTGTAAC TGCTTGGTTT (2) TTTATGTTTA (2) TTTTATGGTT TTTTATGTTT (2) TTTTGTGTTT (2) 108.4 0.1084 E12.5 retina ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTGCCCAGCG CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GTGAACACTG TCTTATGTTT TGCTTGGTTT (2) TTTATGTTTA (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 274.3 0.2743 E14.5 retina ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCCAGCG CTGCCCTCCC CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GCTGCCCCTC TGCTTGGTTT (2) TTTAAGGTTT TTTATGTTTA (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 466.4 0.4664 E16.5 retina ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTGCCCAGCG CTTTATGTTT CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC TGCTTGGTTT (2) TTCTCCCCCC TTTATGTTTA (2) TTTTATGGTT TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) TTTTGTGTTT (2) 572.2 0.5722 E18.5 retina ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCCAGCG CTTTATGTTT CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GCTGCCCCTC TGCTTGGTTT (2) TTTATGTTTA (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 289.2 0.2892 P0.5 retina ACCTTTTCTT CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTGCCCAGCG CTGCCCCAGC CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA TGCCTACAGG TGCTTGGTTT (2) TTTTATGGTT TTTTATGTCT (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 182.7 0.1827 P2.5 retina ACCTTTTCTT CACACAAGCC CCCCCCCCCC (3) CCGCTGCGTG CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA GATGCCCTCC GCTGCCCCTC GTGAACACTG TCTTATGTTT TTCTCCCCCC TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 208 0.208 P4.5 retina ACCTTTTCTT CTGCCCAGCG CTGCCCCAGC CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GCTGCCCCTC TGCCTACAGG TGCTTGGTTT (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 138.9 0.1389 P6.5 retina ACCTTTTCTT ATGCCGTAAA CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTTTCCCTGC (3) GAGTGCCTCA GATGCCCTCC GCTGCCCCTC GGCCTTGCTG (2) TGCTTGGTTT (2) TTTTATGGTT TTTTATGTTT (2) TTTTGTGTTT (2) 126.8 0.1268 P10.5 crx- retina ACCTTTTCTT ATGCCGTAAA CACACAAGCC CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG CTTTATGTTT CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC TGCTTGGTTT (2) TTCTCCCCCC TTTTATGTCT (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) TTTTGTGTTT (2) 303.1 0.3031 P10.5 crx+ retina ACCTTTTCTT CCCCCCCCCC (3) CTTTCCCTGC (3) GATGCCCTCC GCTGCCCCTC TCTTATGTTT TTCTCCCCCC TTTTATGGTT TTTTATGTTT (2) 63.3 0.0633 Adult retinal ACCTTTTCTT CCGCTGCGTG CTGCCAGCGG GAGTGCCTCA GATGCCCTCC GCTGCCCCTC GGCCTTGCTG (2) TGCCTACAGG TTTTATGTTT (2) 48.4 0.0484 ONL CCGCTGCGTG CTGCCCTCCC CTTTATGTTT GAGTGCCTCA GATGCCCTCC TTCTCCCCCC TTTAATGTTT (2) TTTATGTTTA (2) TTTTATGTTA (2) TTTTATGTTT (2) 80.3 0.0803