Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.124176 Limk2LIM motif-containing protein kinase 2 11  11 D  16886 
 Mm.124176 AL022704expressed sequence AL022704 11    103900 
 Mm.124176 A930024P04RikRIKEN cDNA A930024P04 gene 11    320087 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 33 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 98 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCAAGCAGACTA (5)9.80.0098
P8 Cb GCATGATAATAA (5)1.60.0016
P8 Cb GCCCATTTTTAT (3)1.60.0016
P8 Cb GCGAATAAATAA (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaTGATGGGTTG (3)4.60.0046
Cb medulloblastomaGTGGCTGGGG (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureAAGCAGACTA (5)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTGATGGGTTG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATGATAATAA (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCCATTTTTAT (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCGGCGCTGG (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGGGACCCCTG (7)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureGAATAAATAA (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGAGTATGGCC (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGGTACTGG (10)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexTGATGGGTTG (3)4.90.0049
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexAAGCAGACTA (5)4.50.0045
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusGGGACCCCTG (7)5.40.0054
HypothalamusTGATGGGTTG (3)5.40.0054
HypothalamusAAGCAGACTA (5)1.80.0018
HypothalamusATGATAATAA (5)1.80.0018
HypothalamusTAACCCAGGC (8)1.80.0018
HypothalamusTGGGTACTGG (10)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaAAGCAGACTA (5)3.80.0038
E12.5 retinaGAATAAATAA (4)1.90.0019
E12.5 retinaGAGTATGGCC (3)1.90.0019
E12.5 retinaGGGAAGGGGA (5)1.90.0019
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaAAGCAGACTA (5)5.50.0055
E14.5 retinaATGATAATAA (5)1.80.0018
E14.5 retinaGAATAAATAA (4)1.80.0018
E14.5 retinaGCGGCGCTGG (4)1.80.0018
E14.5 retinaTGGGTACTGG (10)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaCCATTTTTAT (3)3.60.0036
E16.5 retinaTGATGGGTTG (3)1.80.0018
E16.5 retinaTGGGTACTGG (10)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaAAGCAGACTA (5)9.10.0091
E18.5 retinaCCATTTTTAT (3)3.60.0036
E18.5 retinaTGATGGGTTG (3)3.60.0036
E18.5 retinaATGATAATAA (5)1.80.0018
E18.5 retinaGAATAAATAA (4)1.80.0018
E18.5 retinaGAGTATGGCC (3)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaAAGCAGACTA (5)20.002
P0.5 retinaGCTCCTGCTT (4)20.002
P0.5 retinaTGATGGGTTG (3)20.002
P0.5 retinaTGGGTACTGG (10)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaGGGAAGGGGA (5)3.50.0035
P2.5 retinaAAGCAGACTA (5)1.80.0018
P2.5 retinaGAATAAATAA (4)1.80.0018
P2.5 retinaTGATGGGTTG (3)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaAAGCAGACTA (5)11.90.0119
P4.5 retinaGCTCCTGCTT (4)20.002
P4.5 retinaGGGAAGGGGA (5)20.002
P4.5 retinaGGGACCCCTG (7)20.002
P4.5 retinaTGGGTACTGG (10)20.002
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaAAGCAGACTA (5)100.01
P6.5 retinaTGATGGGTTG (3)50.005
P6.5 retinaATGATAATAA (5)1.70.0017
P6.5 retinaCCATTTTTAT (3)1.70.0017
P6.5 retinaGCGGCGCTGG (4)1.70.0017
P6.5 retinaTGGGTACTGG (10)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaAAGCAGACTA (5)5.60.0056
P10.5 crx- retinaATGATAATAA (5)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTAACCCAGGC (8)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGGGTACTGG (10)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGGGACCCCTG (7)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTGGCTGGGG (7)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGATGGGTTG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaAAGCAGACTA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaATGATAATAA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGCTGGGG (7)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalAAGCAGACTA (5)5.60.0056
Adult retinalTGATGGGTTG (3)3.70.0037
Adult retinalCCATTTTTAT (3)1.90.0019
Adult retinalGAGTATGGCC (3)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLAAGCAGACTA (5)3.80.0038
ONLATGATAATAA (5)3.80.0038
ONLGAATAAATAA (4)1.90.0019
ONLTGATGGGTTG (3)1.90.0019