Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.125857 D18Ertd653eDNA segment, Chr 18, ERATO Doi 653, expressed 18  18 17.0 cM  52662 
 Mm.125857 4933403F05RikRIKEN cDNA 4933403F05 gene 18    108654 
 Mm.125857 8230401C20RikRIKEN cDNA 8230401C20 gene 18    77493 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 73 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCGTCAAATCAT (4)6.50.0065
P8 Cb GCTGTGTGCGTG (14)1.60.0016
P8 Cb GCTTCTTTCCTG (7)1.60.0016
P8 Cb GCTTTGGGGATG (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaGTCAAATCAT (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaTGTGTGCGTG (14)4.60.0046
Cb medulloblastomaCAAACAAGAT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureTGTGTGCGTG (14)4.60.0046
P8 GC+1d cultureGTCAAATCAT (4)3.40.0034
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureGTCAAATCAT (4)8.20.0082
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGCGTG (14)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTCGTGT (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGTGTTAATAT (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTCTTTCCTG (7)1.20.0012
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
3T3 fibroblastsGTCAAATCAT (4)70.007
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexTGTGTGCGTG (14)4.90.0049
E15 cortexTTTGGGGATG (4)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexTGTGTGCGTG (14)9.10.0091
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusCAAACAAGAT (4)1.80.0018
HypothalamusGTCAAATCAT (4)1.80.0018
HypothalamusGTGTTAATAT (5)1.80.0018
HypothalamusTTTGGGGATG (4)1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaGTGTTAATAT (5)3.80.0038
E12.5 retinaGTCAAATCAT (4)1.90.0019
E12.5 retinaTGTGTGCGTG (14)1.90.0019
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaGTCAAATCAT (4)3.60.0036
E14.5 retinaACCTACTCAG (6)1.80.0018
E14.5 retinaTTCTTTCCTG (7)1.80.0018
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaTGTGTGCGTG (14)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaGTCAAATCAT (4)1.80.0018
E18.5 retinaTTTGGGGATG (4)1.80.0018
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaTGTGTGCGTG (14)3.90.0039
P0.5 retinaGTCAAATCAT (4)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaGTCAAATCAT (4)1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaGTCAAATCAT (4)7.90.0079
P4.5 retinaTTTGGGGATG (4)20.002
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaTGTGTGCGTG (14)6.70.0067
P6.5 retinaCTGTTACCCT (5)3.30.0033
P6.5 retinaGTCAAATCAT (4)1.70.0017
P6.5 retinaTTTGGGGATG (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaGTCAAATCAT (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaCAAACAAGAT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCTGTTACCCT (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGTGTGCGTG (14)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaGTCAAATCAT (4)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaTGTGTCGTGT (4)1.90.0019
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalTGTGTGCGTG (14)9.30.0093
Adult retinalGTCAAATCAT (4)1.90.0019
Adult retinalTTTGGGGATG (4)1.90.0019
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLACCTACTCAG (6)3.80.0038
ONLCAAACAAGAT (4)1.90.0019
ONLCTGTTACCCT (5)1.90.0019
ONLGTCAAATCAT (4)1.90.0019