| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library | 
| P8 Cb GC | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 
 | 17.9 | 0.0179 | 
| Cb medulloblastoma | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 20.7 | 0.0207 | 
| P8 GC+1d culture | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 46.7 | 0.0467 | 
| P8 GC+SHH+1d culture | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 TCTGAGCAGC (4)
 TGTGAAGTCT (6)
 
 | 43.4 | 0.0434 | 
| 3T3 fibroblasts | ACTATAGTCT (4) 
 | 3.5 | 0.0035 | 
| E15 cortex | ACTATAGTCT (4) 
 | 4.9 | 0.0049 | 
| P1 cortex | CTTAATAAAA (6) 
 | 9.1 | 0.0091 | 
| Hypothalamus | ACTATAGTCT (4) CTTAATAAAA (6)
 TGTGAAGTCT (6)
 
 | 9 | 0.009 | 
| E12.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 11.3 | 0.0113 | 
| E14.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 12.7 | 0.0127 | 
| E16.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 TGGATGGAAA (5)
 TGTGAAGTCT (6)
 TTCTTCTTCC (5)
 
 | 39.8 | 0.0398 | 
| E18.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 10.9 | 0.0109 | 
| P0.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 17.7 | 0.0177 | 
| P2.5 retina | CTTAAATAAA (5) CTTAATAAAA (6)
 TCTGAGCAGC (4)
 TGGATGGAAA (5)
 
 | 15.9 | 0.0159 | 
| P4.5 retina | CTTAAATAAA (5) CTTAATAAAA (6)
 TCTGAGCAGC (4)
 
 | 21.8 | 0.0218 | 
| P6.5 retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 15 | 0.015 | 
| P10.5 crx- retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 
 | 35.3 | 0.0353 | 
| P10.5 crx+ retina | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 TTCTTCTTCC (5)
 
 | 19.2 | 0.0192 | 
| Adult retinal | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 CTTAATAAAA (6)
 TTCTTCTTCC (5)
 
 | 9.4 | 0.0094 | 
| ONL | ACTATAGTCT (4) CTTAAATAAA (5)
 
 | 7.6 | 0.0076 |