Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.12866 Chst3carbohydrate (chondroitin 6/keratan) sulfotransferase 3 9    53374 
 Gene Ontology integral to membrane | transferase activity
 Human Homolog CHST3[carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 45 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCCAGATAGAGC (4)1.60.0016
P8 Cb GCGTGTGTGGGG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaCAGATAGAGC (4)11.60.0116
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureCAGATAGAGC (4)3.40.0034
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureCAGATAGAGC (4)2.30.0023
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexCAGATAGAGC (4)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexGTGTGTGGGG (5)4.50.0045
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusCAGATAGAGC (4)1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaCAGATAGAGC (4)9.40.0094
E12.5 retinaTGCCTCTGTG (2)1.90.0019
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaCAGATAGAGC (4)14.60.0146
E14.5 retinaGTGTGTGGGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaCAGATAGAGC (4)1.80.0018
E16.5 retinaTGCCTCTGTG (2)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaCAGATAGAGC (4)12.70.0127
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaCAGATAGAGC (4)3.90.0039
P0.5 retinaTGCCTCTGTG (2)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaCAGATAGAGC (4)14.10.0141
P2.5 retinaGTGTGTGGGG (5)1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaCAGATAGAGC (4)11.90.0119
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaCAGATAGAGC (4)6.70.0067
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaCAGATAGAGC (4)9.30.0093
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaCAGATAGAGC (4)1.90.0019
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalCAGATAGAGC (4)9.30.0093
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLCAGATAGAGC (4)7.70.0077