Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.139926	D9Ertd292e	DNA segment, Chr 9, ERATO Doi 292, expressed	9	9 56.0 cM	52208
Mm.139926	4930506F14Rik	RIKEN cDNA 4930506F14 gene	9		75102
Mm.139926	Rbm6	RNA binding motif protein 6	9		19654
Gene Ontology	nucleus
Human Homolog	RBM6[RNA binding motif protein 6]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 92 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CAAAAATAAA (2) GAACTGGAGT (4) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 75 0.075 Cb medulloblastoma CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) 173.4 0.1734 P8 GC+1d culture CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 69.6 0.0696 P8 GC+SHH+1d culture AAAGAAACAT CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 141.7 0.1417 3T3 fibroblasts CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) 10.5 0.0105 E15 cortex CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) 39.5 0.0395 P1 cortex AAAGAAACAT CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TTTGCTCGAT (3) 49.9 0.0499 Hypothalamus AAAGAAACAT ACTCTTCGAA (3) CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) 110.4 0.1104 E12.5 retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 266.5 0.2665 E14.5 retina ACTCTTCGAA (3) CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 220.3 0.2203 E16.5 retina ACTCTTCGAA (3) CAAAAATAAA (2) GAACTGGAGT (4) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 244.4 0.2444 E18.5 retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 489.4 0.4894 P0.5 retina CAAAAATAAA (2) GAACTGGAGT (4) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 96.2 0.0962 P2.5 retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 315 0.315 P4.5 retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 334.9 0.3349 P6.5 retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 210 0.21 P10.5 crx- retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTTGCTCGAT (3) 122.6 0.1226 P10.5 crx+ retina CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 155.7 0.1557 Adult retinal ACTCTTCGAA (3) CAAAAATAAA (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTAAAAACAA (2) TTTGCTCGAT (3) 107.6 0.1076 ONL CAAAAATAAA (2) GAACTGGAGT (4) TGAAAAAAAA (2) TTAAAAACAA (2) 130.2 0.1302